TreeFam (Tree Families Database) ist eine Datenbank phylogenetischer Bäume von Tiergenen .
Kategorie
Computational phylogenetics
13 Artikel
Die Bayes'sche Inferenz in der Phylogenie kombiniert die Informationen der A-priori-Verteilung und der Daten-Likelihood, um die sogenannte A- posteriori-Wahrscheinlichkeit von Stammbäumen zu berechnen.
David Mark Hillis (* 21. Dezember 1958) ist ein US-amerikanischer Evolutionsbiologe und Alfred W. Roark Centennial Professor für Biologie an der University of Texas in Austin .
In der Evolutionsbiologie bezeichnet man als konservierte Sequenzen identische oder ähnliche Sequenzen in Nukleinsäuren ( DNA und RNA ) oder Proteinen über verschiedene Arten hinweg ( orthologe Sequenzen ), innerhalb
Michael Anthony Steel (* Mai 1960) ist ein neuseeländischer Mathematiker und Statistiker, ein angesehener Professor für Mathematik und Statistik und Direktor des Biomathematics Research Centre an der University of
Die multiple Sequenzanalyse ( MSA ) ist der Prozess oder das Ergebnis der Sequenzalignierung von drei oder mehr biologischen Sequenzen , in der Regel Protein- , DNA- oder RNA- Sequenzen .
In der Bioinformatik ist Neighbor Joining eine Bottom-up- Clustering- Methode (agglomerativ) zur Erstellung phylogenetischer Bäume , die 1987 von Naruya Saitou und Masatoshi Nei entwickelt wurde.
NeighborNet ist ein Algorithmus zur Konstruktion phylogenetischer Netzwerke , der lose auf dem Neighbor-Joining -Algorithmus basiert .
PANDIT ist eine Datenbank mit multiplen Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen, die viele häufige Proteindomänen abdecken .
Die Quartettdistanz ist eine Methode zur Messung des Abstands zwischen zwei phylogenetischen Bäumen .
Die Robinson-Foulds- oder symmetrische Differenzmetrik , oft abgekürzt als RF-Distanz , ist eine einfache Methode zur Berechnung der Distanz zwischen phylogenetischen Bäumen .
In der Bioinformatik bezeichnet man als Sequenzalignment die Anordnung von DNA- , RNA- oder Proteinsequenzen, um Ähnlichkeitsbereiche zu identifizieren, die auf funktionelle, strukturelle oder evolutionäre Beziehungen
UPGMA ( Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean ) ist eine einfache agglomerative (Bottom-up) hierarchische Clustering- Methode.