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Computational phylogenetics

13 Artikel

TreeFam (Tree Families Database) ist eine Datenbank phylogenetischer Bäume von Tiergenen .

SolideComputational phylogenetics
Bayes'sche Inferenz in der Phylogenie

Die Bayes'sche Inferenz in der Phylogenie kombiniert die Informationen der A-priori-Verteilung und der Daten-Likelihood, um die sogenannte A- posteriori-Wahrscheinlichkeit von Stammbäumen zu berechnen.

ExzellentApplications of Bayesian inference

David Mark Hillis (* 21. Dezember 1958) ist ein US-amerikanischer Evolutionsbiologe und Alfred W. Roark Centennial Professor für Biologie an der University of Texas in Austin .

Gut21st-century American zoologists
Konservierte Sequenz

In der Evolutionsbiologie bezeichnet man als konservierte Sequenzen identische oder ähnliche Sequenzen in Nukleinsäuren ( DNA und RNA ) oder Proteinen über verschiedene Arten hinweg ( orthologe Sequenzen ), innerhalb

ExzellentComparative biology
Mike Steel (Mathematiker)

Michael Anthony Steel (* Mai 1960) ist ein neuseeländischer Mathematiker und Statistiker, ein angesehener Professor für Mathematik und Statistik und Direktor des Biomathematics Research Centre an der University of

ExzellentAcademic staff of the University of Canterbury
Multiple Sequenzalignment

Die multiple Sequenzanalyse ( MSA ) ist der Prozess oder das Ergebnis der Sequenzalignierung von drei oder mehr biologischen Sequenzen , in der Regel Protein- , DNA- oder RNA- Sequenzen .

ExzellentBioinformatics
Nachbar schließt sich an

In der Bioinformatik ist Neighbor Joining eine Bottom-up- Clustering- Methode (agglomerativ) zur Erstellung phylogenetischer Bäume , die 1987 von Naruya Saitou und Masatoshi Nei entwickelt wurde.

ExzellentBioinformatics algorithms
Nachbarnetz

NeighborNet ist ein Algorithmus zur Konstruktion phylogenetischer Netzwerke , der lose auf dem Neighbor-Joining -Algorithmus basiert .

GutBioinformatics stubs

PANDIT ist eine Datenbank mit multiplen Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen, die viele häufige Proteindomänen abdecken .

GutBiological database stubs
Quartettabstand

Die Quartettdistanz ist eine Methode zur Messung des Abstands zwischen zwei phylogenetischen Bäumen .

GutBioinformatics algorithms
Robinson-Foulds-Metrik

Die Robinson-Foulds- oder symmetrische Differenzmetrik , oft abgekürzt als RF-Distanz , ist eine einfache Methode zur Berechnung der Distanz zwischen phylogenetischen Bäumen .

ExzellentBioinformatics algorithms
Sequenzausrichtung

In der Bioinformatik bezeichnet man als Sequenzalignment die Anordnung von DNA- , RNA- oder Proteinsequenzen, um Ähnlichkeitsbereiche zu identifizieren, die auf funktionelle, strukturelle oder evolutionäre Beziehungen

ExzellentAlgorithms on strings
UPGMA

UPGMA ( Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean ) ist eine einfache agglomerative (Bottom-up) hierarchische Clustering- Methode.

ExzellentBioinformatics algorithms