PLUMED ist eine Open-Source-Bibliothek, die verbesserte Sampling-Algorithmen, verschiedene Freie-Energie-Methoden und Analysewerkzeuge für Molekulardynamik- Simulationen implementiert.
Kategorie
Molecular dynamics software
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GROMACS ist ein Molekulardynamik- Softwarepaket, das hauptsächlich für Simulationen von Proteinen , Lipiden und Nukleinsäuren entwickelt wurde .
LAMMPS (Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator) ist ein Molekulardynamikprogramm, das von den Sandia National Laboratories entwickelt wurde .
Dies ist eine Liste von Softwareprogrammen für die Computerchemie , die für elektronische Strukturrechnungen , die Vorhersage molekularer Eigenschaften und verwandte Simulationen verwendet werden.
Moleküldesign-Software ist eine bemerkenswerte Software für die Molekülmodellierung , die spezielle Unterstützung für die Entwicklung von Molekülmodellen de novo bietet .
Dies ist eine Liste von Computerprogrammen, die überwiegend für molekularmechanische Berechnungen verwendet werden.