Die 28S ribosomale RNA ist die strukturelle ribosomale RNA (rRNA) der großen Untereinheit (LSU) eukaryotischer cytoplasmatischer Ribosomen und somit einer der grundlegenden Bestandteile aller eukaryotischen Zellen. Sie hat eine Größe von 25S bei Pflanzen und 28S bei Säugetieren, daher die Bezeichnung 25S–28S rRNA . [ 1 ]

In Kombination mit der 5,8S rRNA am 5'-Ende ist sie das eukaryotische nukleäre Homolog der prokaryotischen 23S und der mitochondrialen 16S ribosomalen RNA. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]

Verwendung in der Phylogenie

Phylogenien der mitochondrialen 16S- und der nukleären 28S-ribosomalen DNA von drei Molluskenarten der Gattung Waldo .

Die Gene, die für 28S rRNA kodieren, werden als 28S rDNA bezeichnet. Der Vergleich der Sequenzen dieser Gene wird mitunter in der molekularen Analyse zur Erstellung phylogenetischer Bäume verwendet , beispielsweise bei Protisten [ 5 ] , Pilzen [ 6 ] , Insekten [ 7 ] , Spinnentieren [ 8 ] , Bärtierchen [ 9 ] und Wirbeltieren [ 10 , 11 ] .

Struktur

Die 28S rRNA ist typischerweise 4000–5000 nt lang. [ 12 ]

Einige Eukaryoten spalten die 28S rRNA in zwei Teile, bevor sie beide in das Ribosom einbauen – ein Phänomen, das als „versteckter Bruch“ bezeichnet wird. [ 12 ]

Datenbanken

Mehrere Datenbanken bieten Alignments und Annotationen von LSU-rRNA-Sequenzen zu Vergleichszwecken an:

Referenzen

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