Liste der Software für computergestützte organische Synthese

Computergestützte organische Synthese (CAOS) ist eine Anwendungssoftware, die in der organischen Chemie in Verbindung mit der Computerchemie eingesetzt wird , um die Planung, Vorhersage und Durchführung chemischer Reaktionen zu vereinfachen . CAOS zielt darauf ab, eine Reihe von chemischen Reaktionen zu identifizieren, die ausgehend von einer Ausgangsverbindung ein gewünschtes Molekül erzeugen können . CAOS-Algorithmen verwenden typischerweise zwei Datenbanken : eine mit bekannten chemischen Reaktionen und eine mit bekannten Ausgangsmaterialien (d. h. in der Regel kommerziell erhältlichen Molekülen). Optimale Synthesepläne sind kostengünstiger, weisen eine hohe Ausbeute auf und vermeiden gefährliche Reaktionen und Zwischenprodukte. CAOS wird üblicherweise als Planungsproblem formuliert und hat in diesem Bereich bedeutende Fortschritte erzielt.

• M1 RetroScore powered by CAS – Demo verfügbar, basierend auf ML-Modellen, die mit CAS SciFinder-Daten trainiert wurden [1].
• Syntheseus – [2]
• ChemAIRS – Demoversion verfügbar, entwickelt von Chemical.AI als kommerzielle Software-Suite. Neben der Retrosynthese bietet das Tool einige einzigartige Funktionen wie die Bewertung der synthetischen Zugänglichkeit (SA-Score) und die Prozesschemie. ^{[ 1 ]}
• Spaya – Frei zugängliches Planungstool für die Retrosynthese, bereitgestellt von Iktos. Archiviert am 11.06.2023 im Internetarchiv (Wayback Machine).
• IBM RXN – Ein frei zugänglicher, cloudbasierter Dienst von IBM , der KI-Modelle zur Vorhersage chemischer Reaktionen und zur Generierung von Retrosynthesewegen nutzt. Die Tool-Suite bietet zahlenden Abonnenten außerdem zusätzliche Funktionen wie Roboterintegration und Modellfeinabstimmung. [3]
• AiZynthFinder – Ein frei zugängliches Open-Source-Tool zur retrosynthetischen Planung, entwickelt in Zusammenarbeit zwischen AstraZeneca und der Universität Bern. AiZynthFinder prognostiziert Synthesewege zu einer gegebenen Zielverbindung und kann mit eigenen Datensätzen trainiert werden, unabhängig davon, ob diese aus öffentlichen oder proprietären Quellen stammen. ^{[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]}

• Manifold – ein für akademische Nutzer frei zugängliches Tool zur Suche nach Verbindungen und zur Planung von Retrosynthesen, entwickelt von PostEra. Archiviert am 13.01.2022 im Internet Archive.
• WODCA – keine Testversion; proprietäre Software ^{[ 5 ]}
• Organic Synthesis Exploration Tool (OSET) – Open-Source-Software , aufgegeben ^{[ 6 ]}
• CHIRON – keine Testversion; proprietäre Software ^{[ 7 ]}
• SynGen – Demoversion; proprietäre Software ; ein einzigartiges Programm zur automatischen Generierung organischer Synthesewege; konzentriert sich auf die Erstellung der kürzesten und kostengünstigsten Syntheserouten für eine gegebene organische Zielverbindung und ist somit ein nützliches Werkzeug für die Syntheseplanung.
• LHASA – Demo verfügbar, aber nicht verlinkt (?); proprietäre Software
• SYLVIA – Demoversion; proprietäre Software ; bewertet schnell die Synthesefreundlichkeit organischer Verbindungen; kann Tausende von Strukturen (z. B. generiert durch De-novo-Designexperimente oder aus großen virtuellen Verbindungsbibliotheken abgerufen) nach ihrer synthetischen Komplexität priorisieren ^{[ 8 ].}
• ChemPlanner (ehemals ARChem – Route Designer) ist ein Expertensystem , das Chemikern bei der Entwicklung praktikabler Synthesewege für ihre Zielmoleküle hilft; die Wissensbasis der Reaktionsregeln wird algorithmisch aus Reaktionsdatenbanken abgeleitet, und kommerziell erhältliche Ausgangsmaterialien dienen als Endpunkte für die retrosynthetische Suche.
• ICSYNTH – Demo verfügbar; proprietäre Software ; Ein computergestütztes Synthesedesign-Tool, das Chemikern die Generierung von Synthesewegen für ein Zielmolekül und eines mehrstufigen interaktiven Synthesebaums ermöglicht; Kernstück ist eine algorithmische chemische Wissensbasis mit Transformationsbibliotheken, die automatisch aus Reaktionsdatenbanken generiert werden. ^{[ 9 ]}
• Chematica (jetzt bekannt als Synthia)
• ASKCOS – Open-Source-Suite von Werkzeugen zur Syntheseplanung und computergestützten Chemie. ^{[ 10 ]}

• Vergleich von Software für die molekularmechanische Modellierung
• Moleküldesign-Software
• Moleküleditor
• Molekülmodellierung auf der GPU
• Liste der Software zur Modellierung von Nanostrukturen
• Semi-empirische quantenchemische Methoden
• Computerchemische Methoden in der Festkörperphysik mit periodischen Randbedingungen
• Valence-Anleiheprogramme