Die „Minimum Information About a Microarray Experiment“ ( MIAME ) sind ein von der FGED Society entwickelter Standard für die Berichterstattung über Microarray -Experimente. [ 1 ]
MIAME dient dazu, alle Informationen zu spezifizieren, die für die eindeutige Interpretation der Experimentergebnisse und die potenzielle Reproduktion des Experiments erforderlich sind. Der Standard definiert zwar den Inhalt konformer Berichte, legt aber nicht das Format der Datenpräsentation fest. MIAME beschreibt die Mindestinformationen, die erforderlich sind, um die einfache Interpretation von Microarray-Daten und die unabhängige Verifizierung der Analyseergebnisse zu gewährleisten. [ 2 ] Es existieren verschiedene Dateiformate zur Darstellung dieser Daten sowie öffentliche und kostenpflichtige Repositorien für solche Experimente. [ 2 ] Darüber hinaus gibt es Software zur Unterstützung der Erstellung MIAME-konformer Berichte.
MIAME basiert auf sechs Schlüsselkomponenten: Rohdaten , normalisierte Daten , Probenannotationen, Versuchsplanung , Array-Annotationen und Datenprotokolle.
Referenzen
- ^ „MIAME-Homepage“ . Webseite der FGED Society . Abgerufen am 13.09.2012 .
- ^ a b Brazma, Alvis; Hingamp, Pascal; Quackenbush, John; Sherlock, Gavin; Spellman, Paul; Stoeckert, Chris; Aach, John; Ansorge, Wilhelm; Ball, Catherine A.; Causton, Helen C.; Gaasterland, Terry; Glenisson, Patrick; Holstege, Frank CP; Kim, Irene F.; Markowitz, Victor; Matese, John C.; Parkinson, Helen; Robinson, Alan; Sarkans, Ugis; Schulze-Kremer, Steffen; Stewart, Jason; Taylor, Ronald; Vilo, Jaak; Vingron, Martin (Dezember 2001). „Minimum information about a microarray experiment (MIAME)—toward standards for microarray data“ . Nature Genetics . 29 (4): 365–371 . doi : 10.1038/ng1201-365 . ISSN 1061-4036 . PMID 11726920 . S2CID 6994467 .
