Rhiju Das (geboren 1978 in Houston, Texas) ist ein Computerbiochemiker und Professor für Biochemie und Physik an der Stanford University . Die Forschung in seinem Labor zielt darauf ab, ein prädiktives Verständnis dafür zu gewinnen, wie RNA- Moleküle und ihre Komplexe molekulare Maschinen bilden, die für das Leben grundlegend sind. [ 2 ]
Ausbildung
Das absolvierte zunächst eine Ausbildung zum Physiker, bevor er zur Biochemie wechselte. Sein Physikstudium absolvierte er an der Harvard University , gefolgt von einem Masterstudium als Marshall-Stipendiat an der Universität Cambridge und dem University College London im Bereich experimentelle Kosmologie und molekulare Phylogenetik. Er promovierte in Physik an der Stanford University unter der Betreuung von Sebastian Doniach und Daniel Herschlag .
Karriere
Das war Jane Coffin Childs Postdoktorand und arbeitete mit David Baker an der University of Washington an der Vorhersage von Proteinstrukturen . [ 3 ] 2009 wechselte er an die Biochemie-Abteilung der Stanford University und wurde 2016 zum Professor mit Tenure ernannt. 2021 wurde er zum Howard Hughes Investigator ernannt [ 4 ] und gründete im selben Jahr das RNA-Design-Startup Inceptive mit. [ 5 ]
Forschung
Das entwickelt Methoden zur Simulation und zum computergestützten Design von RNA-Molekülen sowie experimentelle Methoden zur Ableitung der RNA-Struktur aus mehrdimensionalen chemischen Kartierungsmessungen. [ 6 ] In diesem Zusammenhang leitet Das das Massive Open Laboratory Eterna , das ein internetbasiertes Videospiel mit massiv parallelen Experimenten und maschinellem Lernen verbindet. [ 7 ] Ziel des Projekts ist es, Bürgerwissenschaftler zur Entwicklung neuer Medikamente zu befähigen. [ 8 ]
Im Jahr 2020 nutzten Das und seine Mitarbeiter die Eterna-Plattform, um potenziell lagerstabile RNA-Impfstoffe gegen COVID-19 zu untersuchen . [ 9 ] Ein Interview mit Das über diese Arbeit wurde im Mai 2020 in einer Folge von Nova mit dem Titel „ Decoding COVID-19 “ ausgestrahlt . [ 10 ]
Das ist außerdem bekannt für seine Arbeiten zur Anwendung der Kryo-Elektronenmikroskopie zur Beschleunigung der Strukturbestimmung von RNA. [ 11 ] Er war an der Einführung der ersten RNA-Kategorie in der Critical Assessment of Structure Prediction im Jahr 2022 beteiligt und fungierte als Gutachter. [ 12 ]
Referenzen
- ^ „OSSM-Absolvent an vorderster Front der COVID-19-Impfstoffforschung“ . www.ossmfoundation.org . 22. Mai 2020. Archiviert vom Original am 18. April 2022.Abgerufen am 18. April 2022.
- ^ https://profiles.stanford.edu/rhiju-das Fakultätsprofil
- ^ https://www.dropbox.com/s/507ly1p2f25kojp/RhijuDas_CurriculumVitae.pdf?dl=0 CV
- ^ „Drei Fakultätsmitglieder als HHMI-Forscher ernannt“ . 23. September 2021.
- ^ Toews, Rob. „Eine Welle von milliardenschweren Startups im Bereich Sprach-KI kommt“ . Forbes . Abgerufen am 19.12.2023 .
- ^ Cheng, Clarence Yu; Chou, Fang-Chieh; Kladwang, Wipapat; Tian, Siqi; Cordero, Pablo; Das, Rhiju (2. Juni 2015). „ Konsistente globale Strukturen komplexer RNA-Zustände durch multidimensionale chemische Kartierung“ . eLife . 4 e07600. doi : 10.7554/eLife.07600 . PMC 4495719. PMID 26035425 .
- ^ „RNA-Spiel lässt Spieler bei der Suche nach einem biologischen Preis mithelfen“ . The New York Times . 11. Januar 2011.
- ^ Hotz, Robert Lee (3. Mai 2016). „Videospieler werden rekrutiert, um Tuberkulose und andere Krankheiten zu bekämpfen“ . Wall Street Journal .
- ^ Skarky, Brent (25. Mai 2020). „Oklahoman führt die Suche nach einem Impfstoff gegen COVID-19 an“ . KFOR-TV .
- ^ Holt, Sarah (13. Mai 2020). „COVID-19 entschlüsseln“ . Nova . COVID-19 entschlüsseln – via KFOR-TV .
- ^ Kappel, Kalli; Zhang, Kaiming; Su, Zhaoming; Watkins, Andrew M.; Kladwang, Wipapat; Li, Shanshan; Pintilie, Grigore; Topkar, Ved V.; Rangan, Ramya; Zheludev, Ivan N.; Yesselman, Joseph D.; Chiu, Wah; Das, Rhiju (Juli 2020). „Beschleunigte kryo-EM-gesteuerte Bestimmung dreidimensionaler reiner RNA-Strukturen“ . Naturmethoden . 17 (7): 699–707 . doi : 10.1038/s41592-020-0878-9 . ISSN 1548-7105 . PMC 7386730 . PMID 32616928 .
- ^ Das, Rhiju; Kretsch, Rachael C.; Simpkin, Adam J.; Mulvaney, Thomas; Pham, Phillip; Rangan, Ramya; Bu, Fan; Keegan, Ronan M.; Topf, Maya; Rigden, Daniel J.; Miao, Zhichao; Westhof, Eric (Dezember 2023). „Bewertung der dreidimensionalen RNA-Strukturvorhersage in CASP15“ . Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics . 91 (12): 1747–1770 . doi : 10.1002 / prot.26602 . ISSN 0887-3585 . PMC 10841292. PMID 37876231 .