Bioinformatics

Das Access to Biological Collections Data ( ABCD ) -Schema ist ein hochstrukturiertes Datenaustausch- und Zugriffsmodell für Taxonvorkommensdaten (Exemplare, Beobachtungen usw. von lebenden Organismen), d. h.

Die Suspensionsarray-Technologie ( SAT ) ist eine Hochdurchsatz-Screening-Plattform für großflächige und multiplexe Analysen in der Molekularbiologie .

Die Basenbestimmung ist der Prozess der Zuordnung von Nukleobasen zu Chromatogrammpeaks , Lichtintensitätssignalen oder elektrischen Stromänderungen, die durch den Durchtritt von Nukleotiden durch eine Nanopore entstehen

Die Bildinformatik , auch bekannt als Radiologieinformatik oder medizinische Bildinformatik , ist ein Teilgebiet der biomedizinischen Informatik , das die Effizienz, Genauigkeit, Benutzerfreundlichkeit und

Die Biobildinformatik ist ein Teilgebiet der Bioinformatik und der Computerbiologie .

In der Molekularbiologie sind Biochips künstlich hergestellte Substrate („miniaturisierte Labore“) , die eine Vielzahl biochemischer Reaktionen simultan ermöglichen .

The Bioinformatics Open Source Conference (BOSC) is an academic conference on open-source programming and other open science practices in bioinformatics, organised by the Open Bioinformatics Foundation.

Bioinformatik ( / ˌ b aɪ . oʊ ˌ ɪ n f ər ˈ m æ t ɪ k s /Bioinformatik (ⓘ ) ist eininterdisziplinäresWissenschaftsgebiet,das computergestützte Methoden undSoftware-Toolszur AnalysebiologischerDaten entwickelt,

Biologische Daten bezeichnen Verbindungen oder Informationen, die aus lebenden Organismen und deren Produkten gewonnen werden.

Biomimetik oder Biomimikry bezeichnet die Nachbildung von Modellen, Systemen und Elementen der Natur zur Lösung komplexer menschlicher Probleme.

BioPAX (Biological Pathway Exchange) ist eine auf RDF / OWL basierende Standardsprache zur Darstellung biologischer Signalwege auf molekularer und zellulärer Ebene. Ihr Hauptzweck ist der Austausch von Signalwegdaten.

Biopunk (ein Kofferwort aus „ Biotechnologie “ oder „ Biologie “ und „ Punk “) ist ein Subgenre des Science-Fiction -Subgenres Cyberpunk , das sich auf Biotechnologie konzentriert.

Critical Assessment of Structure Prediction ( CASP ), auch bekannt als Critical Assessment of Protein Structure Prediction , ist ein weltweites, gemeinschaftliches Experiment zur Vorhersage von Proteinstrukturen, das

CERNO (Coincident Extreme Ranks in Numerical Observations) ist ein nichtparametrischer, rangbasierter statistischer Test, der die Rangverteilung einer markierten Teilmenge von Proben (die Markierungen definieren die

Die Computerbiologie bezeichnet die Anwendung von Techniken aus der Informatik , der Datenanalyse , der mathematischen Modellierung und computergestützten Simulationen zum Verständnis biologischer Systeme und

Die computergestützte Genomik bezeichnet die Anwendung computergestützter und statistischer Analysen zur Entschlüsselung biologischer Prozesse anhand von Genomsequenzen und verwandten Daten .

Darwin Core (often abbreviated to DwC) is an extension of Dublin Core for biodiversity informatics. It is meant to provide a stable standard reference for sharing information on biological diversity (biodiversity).

Das Darwin Core Archive (DwC-A) ist ein Datenstandard für Biodiversitätsinformatik , der die Darwin-Core- Begriffe nutzt , um einen einzigen, in sich geschlossenen Datensatz für Artenvorkommen, Checklisten,

Eine Codontabelle dient der Übersetzung des genetischen Codes in eine Aminosäuresequenz .

DNA-bindende Proteine ​​sind Proteine ​​mit DNA-Bindungsdomänen und besitzen daher eine spezifische oder allgemeine Affinität zu einzel- oder doppelsträngiger DNA .

DNA-Bindungsstellen sind eine Art von Bindungsstellen in der DNA , an die andere Moleküle binden können. Sie unterscheiden sich von anderen Bindungsstellen dadurch, dass sie (1) Teil einer DNA-Sequenz (z. B.

Im Bereich der Molekülmodellierung ist Docking eine Methode, die die bevorzugte Orientierung eines Moleküls relativ zu einem zweiten vorhersagt, wenn ein Ligand und ein Zielmolekül einen stabilen Komplex bilden .

In der Statistik ist ein Dual-Flashlight-Plot eine Art Streudiagramm, in dem der standardisierte Mittelwert einer Kontrastvariablen ( SMCV ) gegen den Mittelwert einer anderen Kontrastvariablen aufgetragen wird , die

In der Molekularbiologie ist Protein-Threading , auch Faltungserkennung genannt , eine Methode der Proteinmodellierung.

Engineering biology is the set of methods for designing, building, and testing engineered biological systems which have been used to manipulate information, construct materials, process chemicals, produce energy, provide

Das Ensembl-Genomdatenbankprojekt ist ein wissenschaftliches Projekt des Europäischen Bioinformatik-Instituts (EBI) und bietet Genetikern, Molekularbiologen und anderen Forschern, die die Genome unserer eigenen Spezies

Exscalate4Cov war ein öffentlich-privates Konsortium , das vom Programm Horizon Europe der Europäischen Union gefördert wurde und darauf abzielte, Hochleistungsrechner (HPC) als Antwort auf die Coronavirus- Pandemie zu

Fluxomics beschreibt verschiedene Ansätze zur Bestimmung der Raten metabolischer Reaktionen in einem biologischen Organismus.

Die Gennomenklatur ist die wissenschaftliche Benennung von Genen , den Einheiten der Vererbung in lebenden Organismen.

Die GenBank -Sequenzdatenbank ist eine frei zugängliche , annotierte Sammlung öffentlich verfügbarer Nukleotidsequenzen und ihrer Proteinübersetzungen .

In der Computerbiologie bezeichnet Genvorhersage oder Genfindung den Prozess der Identifizierung von Genabschnitten im Genom, die für Gene kodieren .

GISAID ( ausgesprochen / ˈɡɪseɪd / ) , die Globale Initiative zum Austausch aller Influenzadaten , ehemals Globale Initiative zum Austausch von Daten zur Vogelgrippe , ist eine 2008 gegründete globale

Eine Heatmap ist eine zweidimensionale Datenvisualisierungstechnik , die die Stärke einzelner Werte innerhalb eines Datensatzes farblich darstellt. Die Farbvariation kann durch Farbton oder Intensität erfolgen .

Homologiemodellierung , auch bekannt als vergleichende Proteinmodellierung , bezeichnet die Erstellung eines Modells mit atomarer Auflösung des Zielproteins anhand seiner Aminosäuresequenz und der experimentell

Das Humangenomprojekt ( HGP ) war ein internationales wissenschaftliches Forschungsprojekt mit dem Ziel, die Basenpaare der menschlichen DNA zu bestimmen und alle Gene des menschlichen Genoms sowohl physikalisch als auch

Das Humanmikrobiom-Projekt ( HMP ) war eine Forschungsinitiative der National Institutes of Health (NIH) der Vereinigten Staaten, die das Verständnis der Mikrobiota im Zusammenhang mit menschlicher Gesundheit und

Intelligent Systems for Molecular Biology ( ISMB ) ist eine jährlich stattfindende wissenschaftliche Konferenz zu den Themen Bioinformatik und Computerbiologie, die von der International Society for Computational Biology

In der Molekularbiologie bezeichnet das Interaktom die Gesamtheit der molekularen Wechselwirkungen in einer bestimmten Zelle .

Die Canadian Bioinformatics Workshops (CBW) sind eine Reihe von Fortbildungsworkshops in Bioinformatik , die seit 1999 in ganz Kanada angeboten werden.

Dies ist eine Liste von Werken, die dem Biopunk zugeordnet werden , einem Subgenre der Science-Fiction , das aus der Cyberpunk -Bewegung hervorgegangen ist.

Life Science Identifiers dienen der Benennung und dem Auffinden von Informationen im Web.

Das Metabolom ist die Gesamtheit aller niedermolekularen chemischen Verbindungen in einer biologischen Probe.

Die Metagenomik untersucht das gesamte genetische Material aller Organismen in einer bestimmten Umgebung ( Umwelt-DNA ) und liefert Erkenntnisse über deren Zusammensetzung, Diversität und funktionelles Potenzial.

Metatranskriptomik ist die Gesamtheit der Techniken, die zur Untersuchung der Genexpression von Mikroorganismen in natürlichen Umgebungen, d. h. des Metatranskriptoms, eingesetzt werden.

Die Modellierung metabolischer Netzwerke , auch bekannt als Rekonstruktion metabolischer Netzwerke oder Analyse metabolischer Stoffwechselwege , ermöglicht einen tiefen Einblick in die molekularen Mechanismen eines

Modelling biological systems is a significant task of systems biology and mathematical biology.Computational systems biology aims to develop and use efficient algorithms, data structures, visualization and communication

Morphometrie (von griechisch μορΦή morphe , „Gestalt“, und -μετρία metria , „Messung“) bezeichnet die quantitative Analyse der Form , ein Konzept, das Größe und Gestalt umfasst.

Die multiple Sequenzanalyse ( MSA ) ist der Prozess oder das Ergebnis der Sequenzalignierung von drei oder mehr biologischen Sequenzen , in der Regel Protein- , DNA- oder RNA- Sequenzen .

Neuroinformatik ist ein aufstrebendes Forschungsgebiet, das Informatik und Neurowissenschaften vereint .

Ein Patrocladogramm ist ein kladistisches Verzweigungsmuster, das mithilfe patristischer Distanzen (d. h. Divergenzen zwischen Abstammungslinien) präzise modifiziert wurde; es ist eine Art Phylogramm .

Pfam ist eine Datenbank von Proteinfamilien , die deren Annotationen und mithilfe von Hidden-Markov-Modellen generierte multiple Sequenzalignments enthält .

Das Visible Embryo Project ( VEP ) ist ein institutionenübergreifendes, multidisziplinäres Forschungsprojekt, das Anfang der 1990er-Jahre als Kooperation zwischen dem Developmental Anatomy Center des National Museum of

Die Proteindatenbank (PDB) ist eine Datenbank für die dreidimensionalen Strukturdaten großer biologischer Moleküle wie Proteine ​​und Nukleinsäuren , die von der Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) verwaltet wird .

Die Primärstruktur eines Proteins ist die lineare Abfolge der Aminosäuren in einem Peptid oder Protein .

In der Bioinformatik ist ein Punktediagramm eine grafische Methode zum Vergleich zweier biologischer Sequenzen und zur Identifizierung von Bereichen hoher Ähnlichkeit nach der Sequenzausrichtung .

Eine akzeptierte Punktmutation (PAM) ist der Austausch einer einzelnen Aminosäure in der Primärstruktur eines Proteins durch eine andere, der durch die natürliche Selektion akzeptiert wird .

Semantische Integration ist der Prozess der Verknüpfung von Informationen aus unterschiedlichen Quellen, beispielsweise Kalendern und Aufgabenlisten, E-Mail-Archiven, Präsenzinformationen (physisch, psychisch und

In der Bioinformatik ist ein Sequenzlogo eine grafische Darstellung der Sequenzkonservierung von Nukleotiden (in einem DNA- / RNA- Strang ) oder Aminosäuren (in Proteinsequenzen ).

In der Biologie bezeichnet man als Sequenzmotiv ein weit verbreitetes Nukleotid- oder Aminosäuresequenzmuster , das üblicherweise mit der biologischen Funktion des Makromoleküls in Zusammenhang gebracht wird.

In der Genetik ist die Shotgun -Sequenzierung eine Methode zur Sequenzierung zufälliger DNA- Stränge. Sie ist nach der schnell expandierenden, quasi-zufälligen Schussgruppe einer Schrotflinte benannt .

Die Einzelnukleotid-Polymorphismus-Annotation ( SNP- Annotation) ist der Prozess der Vorhersage der Wirkung oder Funktion eines einzelnen SNPs mithilfe von SNP-Annotationswerkzeugen.

In der Molekularbiologie ist ein SNP-Array eine Art DNA-Microarray , der zur Erkennung von Polymorphismen innerhalb einer Population eingesetzt wird.

Die strukturelle Genomik zielt darauf ab, die dreidimensionale Struktur aller von einem gegebenen Genom kodierten Proteine ​​zu beschreiben .

In der Bioinformatik und Evolutionsbiologie beschreibt eine Substitutionsmatrix die Häufigkeit, mit der sich ein Merkmal in einer Nukleotid- oder Proteinsequenz im Laufe der Evolution verändert .

Systembiologie ist die computergestützte und mathematische Analyse und Modellierung komplexer biologischer Systeme .

In der Wahrscheinlichkeitstheorie ist ein Hidden-Markov-Modell ( HMM ) ein Markov-Modell , bei dem die Beobachtungen von einem latenten (oder verborgenen ) Markov-Prozess abhängen (im Folgenden als „Hidden

Methoden zur Vorhersage der Proteinfunktion sind Techniken, die Bioinformatiker nutzen, um Proteinen biologische oder biochemische Rollen zuzuordnen .

Whole genome sequencing (WGS), also known as full genome sequencing or just genome sequencing, is the process of determining the entirety of the DNA sequence of an organism's genome at a single time.

Ein zelluläres Modell oder eine virtuelle Zelle ist ein Computermodell von Aspekten einer biologischen Zelle , das für Zwecke der In-silico -Forschung entwickelt wurde.