Eine biologische Probe (auch Bioprobe genannt ) ist eine biologische Laborprobe, die in einer Biobank für Forschungs-, Lehr- oder Diagnosezwecke aufbewahrt wird. Sie wird durch Stichprobenentnahme so gewonnen, dass sie repräsentativ für alle anderen Proben aus der gleichen Quelle ist. Idealerweise behalten biologische Proben während der Lagerung ihre Eigenschaften, die für Forschungszwecke frisch entnommenen Proben entsprechen.
Menschliche biologische Proben werden in einer Art Biobank aufbewahrt , und die Wissenschaft der Konservierung biologischer Proben ist im Bereich des Biobankings am aktivsten.
Qualitätskontrolle
Die Festlegung umfassender Qualitätsstandards für biologische Proben war anfangs ein unterentwickelter Aspekt des Biobank-Wachstums. [ 1 ] Derzeit wird diskutiert, welche Standards gelten sollten und wer für deren Verwaltung zuständig sein sollte. Da viele Organisationen ihre eigenen Standards festlegen und Biobanken zwangsläufig von mehreren Organisationen genutzt werden und typischerweise auf Expansion ausgerichtet sind, hat die Harmonisierung von Standardarbeitsanweisungen für Laborpraktiken hohe Priorität. [ 1 ] Die Verfahren müssen evidenzbasiert sein und werden sich mit der Zeit durch neue Forschungsergebnisse und Technologien weiterentwickeln. [ 1 ]
politische Entscheidungsträger
Zu den Fortschritten bei der Schaffung von Organisationen zur Politikgestaltung zählen die Gründung des Office of Biobanking and Biospecimen Research (OBBR) durch das National Cancer Institute im Jahr 2005 [ 1 ] sowie die jährlichen Symposien des Biospecimen Research Network [ 2 ] . Auch die International Society for Biological and Environmental Repositories , die Internationale Agentur für Krebsforschung (IARC), die Organisation für wirtschaftliche Zusammenarbeit und Entwicklung (OECD) und das Australasian Biospecimen Network haben Richtlinien und Standards vorgeschlagen [ 1 ] . Im Jahr 2008 veröffentlichte AFNOR , eine französische Normungsorganisation, den ersten biobankspezifischen Qualitätsstandard [1]. Aspekte der ISO 9000 wurden auf Biobanken angewendet [ 1 ] .
Qualitätsziele
Die Qualitätskriterien für Proben hängen von der jeweiligen Studie ab, und es gibt keinen universellen Standard für Probentypen. [ 1 ] Die DNA-Integrität ist ein wichtiger Faktor für Studien mit Ganzgenomamplifikation. [ 3 ] Die RNA-Integrität ist für einige Studien entscheidend und kann mittels Gelelektrophorese beurteilt werden . [ 4 ] Auch Biobanken, die Proben lagern, können nicht die volle Verantwortung für deren Integrität übernehmen, da die Proben vor ihrer Übernahme gesammelt und verarbeitet werden müssen und Effekte wie RNA-Degradation eher durch verzögerte Probenverarbeitung als durch unzureichende Lagerung entstehen. [ 5 ]
Proben gelagert
Biobanken lagern verschiedene Arten von Proben. Unterschiedliche Proben sind für unterschiedliche Zwecke nützlich.
| Biobankproben | ||||
|---|---|---|---|---|
| Probe | Verwendung | Extraktionstechnik | Lagerung | Eigenschaften |
| Wangentaschentuch | DNA-Profilierung | Mundschleimhautabstrich | Die Teilnehmer können die Materialien selbst abholen; die Abholung kann per Post erfolgen; die Abholung ist so einfach, dass die Einholung der informierten Einwilligung möglicherweise nicht ausreichend berücksichtigt wird. | |
| Vollblut | Venenpunktion | benötigt einen Phlebotomisten zur Datenerhebung | ||
| getrockneter Blutfleck | liefert hochwertige DNA und RNA | Fingerstick | Lässt sich bei Raumtemperatur problemlos jahrelang lagern. | |
| Organgewebe | liefert hochwertige DNA , RNA , mitochondriale DNA und ist die Quelle von Krankheiten. | Biopsie | Viele Anwendungsgebiete werden auch mit Blutprodukten genutzt; auch für proteomische Analysen geeignet; die Gewinnung kann schwierig sein. | |
| Plasma | begrenzter DNA- und RNA-Gehalt | Blutplasma-Fraktionierung | benötigt einen Phlebotomisten zur Datenerhebung | |
| Urin | Marker für einige diagnostische Tests | Urinieren | nicht-invasiv | |
| Kot | Marker für einige diagnostische Tests | Stuhlprobe | nicht-invasiv | |
| Haut | Wird hauptsächlich von forensischen Teams verwendet, die Kriminalfälle untersuchen. | in Strafsachen, ohne Einwilligung des Spenders gesammelt | ||
| Haar | Wird hauptsächlich von forensischen Teams verwendet, die Kriminalfälle untersuchen. | Haaranalyse | in Strafsachen, ohne Einwilligung des Spenders gesammelt | |
Speichertechniken
Viele Proben in Biobanken werden kryokonserviert . Andere Proben werden auf andere Weise gelagert. [ 6 ]
Techniken im Zusammenhang mit Biobanken
Zu den Labortechniken, die mit der Lagerung biologischer Proben in Verbindung gebracht werden, gehören die Phenol-Chloroform-Extraktion , die PCR und die RFLP .
Siehe auch
Referenzen
- ^ a b c d e f g h Hewitt, RE (2011). „Biobanking: Die Grundlage der personalisierten Medizin“. Current Opinion in Oncology . 23 (1): 112–119 . doi : 10.1097/CCO.0b013e32834161b8 . PMID 21076300 .
- Moore , H. M.; Compton, C. C.; Lim, M. D.; Vaught, J.; Christiansen, K. N.; Alper, J. (2009). „2009 Biospecimen Research Network Symposium: Advancing Cancer Research Through Biospecimen Science“ . Cancer Research . 69 (17): 6770–6772 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-09-1795 . PMC 2782665. PMID 19706749 .
- ^ Yuille, M.; Illig, T.; Hveem, K.; Schmitz, G.; Hansen, J.; Neumaier, M.; Tybring, G.; Wichmann, E.; Ollier, B. (2010). „Labormanagement von Proben in Biobanken: Bericht der Europäischen Expertengruppe im Konsens“. Biopreservation and Biobanking . 8 (1): 65–9 . doi : 10.1089/bio.2010.8102 . PMID 24836342 .
- ^ Guerin, JS; Murray, DW; McGrath, MM; Yuille, MA; McPartlin, JM; Doran, PP (2010). „Molecular Medicine Ireland Guidelines for Standardized Biobanking“. Biopreservation and Biobanking . 8 (1): 3–63 . doi : 10.1089/bio.2010.8101 . PMID 24836341 .
- Barnes , MG; Grom, AA; Griffin, TA; Colbert, RA; Thompson, SD (2010). „Genexpressionsprofile von mononukleären Zellen des peripheren Blutes reagieren empfindlich auf kurze Verarbeitungsverzögerungen“ . Biopreservation and Biobanking . 8 (3): 153–162 . doi : 10.1089/bio.2010.0009 . PMC 3129811. PMID 21743826 .
- Elliott , P.; Peakman, T. C.; Uk, B. (2008). „Das UK Biobank-Protokoll zur Probenhandhabung und -lagerung für die Sammlung, Verarbeitung und Archivierung von menschlichem Blut und Urin“ . International Journal of Epidemiology . 37 (2): 234–244 . doi : 10.1093/ije/dym276 . PMID 18381398 .
Externe Links
- Biospecimen-Forschungsdatenbank , eine kuratierte Sammlung von Artikeln über Biospecimen
- Büro für Biobanken und Bioprobenforschung
- Specimen Central Biorepository-Liste , eine weltweite Auflistung aktiver Biobanken und Biorepositorien
- Symposien des Biospecimen Research Network , eine Konferenz über Biobankproben
- Artikel der Mayo Clinic zum Thema Biobanking (Archiviert am 06.04.2012 im Internet Archive) .
- Kurzer Beitrag des öffentlich-rechtlichen Fernsehens über Museumssammlungen
- Dienstleistungen zur Sammlung von Bioproben