Isoschizomer

Isoschizomere sind Paare von Restriktionsenzymen, die spezifisch für dieselbe Erkennungssequenz sind . ^{[ 1 ]} Der Begriff leitet sich vom Griechischen iso „ gleich “ und skihzo „ spalten “ ab . ^{[ 2 ] [ 3 ]}

Das erste entdeckte Enzym , das eine bestimmte Sequenz erkennt, wird als Prototyp bezeichnet ; alle nachfolgend identifizierten Enzyme, die diese Sequenz erkennen, sind Isoschizomere. ^{[ 4 ]} Beispielsweise besitzt der Prototyp SphI (CGTAC/G) die Isoschizomere BbuI (CGTAC/G) und PaeI. ^{[ 5 ]}

In einigen Fällen kann nur eines von zwei Isoschizomeren sowohl die methylierte als auch die unmethylierte Form von Restriktionsstellen erkennen, während das andere Enzym nur die unmethylierte Form erkennt. ^{[ 6 ]} Diese Eigenschaft der Isoschizomere ermöglicht die Identifizierung von Methylierungszuständen. Beispielsweise erkennen die Isoschizomere HpaII und MspI beide die Sequenz 5'-CCGG-3', wenn diese unmethyliert ist. ^{[ 7 ]} Ist jedoch das zweite C der Sequenz methyliert, kann nur MspI diese erkennen.

Ein Enzym, das dieselbe Sequenz erkennt, sie aber an einer anderen Position spaltet, ist ein Neoschizomer . ^{[ 1 ] [ 4 ]} Neoschizomere sind eine Untergruppe der Isoschizomere. Beispielsweise sind SmaI (CCC/GGG) und XmaI (C/CCGGG) Neoschizomere voneinander. Ebenso sind KpnI (GGTAC/C) und Acc65I (G/GTACC) Neoschizomere voneinander. Ein Enzym, das eine leicht abweichende Sequenz erkennt, aber die gleichen Enden erzeugt, ist ein Isocaudomer . ^{[ 8 ]}