RecQ-Protein-ähnliches 4
Kennungen
SymbolRECQL4
NCBI-Gen9401
HGNC9949
OMIM603780
RefSeqNM_004260
UniProtO94761
Andere Daten
OrtChr. 8 q24.3
Suchen nach
StrukturenSchweizer Modell
DomänenInterPro
RecQ-Protein-ähnliches 5
Kennungen
SymbolRECQL5
NCBI-Gen9400
HGNC9950
OMIM603781
RefSeqNM_004259
UniProtO94762
Andere Daten
OrtChr. 17 q25
Suchen nach
StrukturenSchweizer Modell
DomänenInterPro
RMI1, RecQ-vermittelte Genominstabilität 1
Kennungen
SymbolRMI1
AlternativsymboleC9orf76
NCBI-Gen80010
HGNC25764
OMIM610404
RefSeqNM_024945
UniProtQ9H9A7
Andere Daten
OrtChr. 9 q22.1
Suchen nach
StrukturenSchweizer Modell
DomänenInterPro
Werner-Syndrom
Kennungen
SymbolWRN
NCBI-Gen7486
HGNC12791
OMIM604611
RefSeqNM_000553
UniProtQ14191
Andere Daten
OrtChr. 8 S.
Suchen nach
StrukturenSchweizer Modell
DomänenInterPro

RecQ-Helikasen sind eine Familie von Helikase- Enzymen, die ursprünglich in Escherichia coli entdeckt wurden [ 1 ] und eine wichtige Rolle bei der Genomerhaltung spielen [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] . Sie katalysieren die Reaktion ATP + H₂O → ADP + P und bewirken so das Entwinden gepaarter DNA und die Translokation in 3'-5'-Richtung. Diese Enzyme können auch die Reaktion NTP + H₂O → NDP + P katalysieren und dadurch sowohl DNA als auch RNA entwinden .

Funktion

Bei Prokaryoten ist RecQ für die Plasmidrekombination und die DNA-Reparatur nach UV-Licht, freien Radikalen und Alkylierungsmitteln unerlässlich . Dieses Protein kann zudem Schäden durch Replikationsfehler rückgängig machen. Bei Eukaryoten verläuft die Replikation ohne RecQ-Proteine ​​nicht normal; diese Proteine ​​spielen außerdem eine Rolle bei Alterungsprozessen, Genstilllegung, Rekombination und DNA-Reparatur.

Struktur

Die Mitglieder der RecQ-Familie weisen drei gemeinsame Regionen konservierter Proteinsequenzen auf, die als die folgenden bezeichnet werden:

  • N-Terminus – Helikase
  • Mitte – RecQ-erhaltend (RecQ-Ct) und
  • C-terminal – Helicase- und RNase-D C-terminale (HRDC) Domänen.

Die Entfernung der N-terminalen Aminosäuren (Helikase- und RecQ-Ct-Domäne) beeinträchtigt sowohl die Helikase- als auch die ATPase-Aktivität, hat aber keinen Einfluss auf die Bindungsfähigkeit von RecQ. Dies deutet darauf hin, dass der N-Terminus als katalytisches Ende fungiert. Verkürzungen des C-Terminus (HRDC-Domäne) beeinträchtigen die Bindungsfähigkeit von RecQ, nicht aber die katalytische Funktion. Die Bedeutung von RecQ für zelluläre Funktionen wird durch menschliche Erkrankungen verdeutlicht, die alle zu genomischer Instabilität und einer Prädisposition für Krebs führen.

Klinische Bedeutung

Es gibt mindestens fünf menschliche RecQ-Gene; Mutationen in drei dieser Gene sind mit erblichen Erkrankungen assoziiert: das WRN- Gen beim Werner-Syndrom (WS), das BLM- Gen beim Bloom-Syndrom (BS) und RECQL4 beim Rothmund-Thomson-Syndrom . [ 5 ] Diese Syndrome sind durch vorzeitiges Altern gekennzeichnet und können zu Erkrankungen wie Krebs , Typ-2 - Diabetes , Osteoporose und Arteriosklerose führen , die häufig im höheren Alter auftreten. Diese Erkrankungen gehen mit einer hohen Inzidenz von Chromosomenaberrationen einher, darunter Chromosomenbrüche, komplexe Umlagerungen, Deletionen und Translokationen, ortsspezifische Mutationen und insbesondere Schwesterchromatidaustausche (häufiger beim BS), die vermutlich durch eine hohe somatische Rekombinationsrate verursacht werden.

Mechanismus

Die korrekte Funktion der RecQ-Helikasen erfordert die spezifische Interaktion mit der Topoisomerase III (Top 3). Top 3 verändert den topologischen Zustand der DNA, indem es einzelsträngige DNA bindet und spaltet. Dabei wird entweder ein einzelsträngiges oder ein doppelsträngiges DNA-Segment durch den vorübergehenden Bruch transportiert und dieser anschließend wieder verbunden. Die Interaktion der RecQ-Helikase mit der Topoisomerase III im N-terminalen Bereich ist an der Unterdrückung spontaner und durch DNA-Schäden induzierter Rekombination beteiligt. Das Fehlen dieser Interaktion führt zu einem letalen oder sehr schweren Phänotyp. Es zeigt sich deutlich, dass RecQ-Helikasen gemeinsam mit Top 3 die genomische Stabilität und Integrität aufrechterhalten, indem sie Rekombinationsereignisse kontrollieren und DNA-Schäden in der G2-Phase des Zellzyklus reparieren. Die Bedeutung von RecQ für die genomische Integrität wird durch die Krankheiten verdeutlicht, die als Folge von Mutationen oder Funktionsstörungen der RecQ-Helikasen entstehen. Daher ist die Anwesenheit und Funktion von RecQ entscheidend für ein gesundes menschliches Wachstum und eine gesunde Entwicklung.

WRN-Helikopter

Die Werner-Syndrom -ATP-abhängige Helikase (WRN-Helikase) ist unter den Helikasen der RecQ-DNA-Familie insofern ungewöhnlich, als sie zusätzlich eine Exonukleaseaktivität aufweist . WRN interagiert mit DNA-PKcs und dem Ku-Proteinkomplex . Diese Beobachtung, zusammen mit dem Nachweis, dass WRN-defiziente Zellen umfangreiche Deletionen an den Verbindungsstellen nicht-homologer DNA-Enden aufweisen, deutet auf eine Rolle des WRN-Proteins im DNA-Reparaturprozess der nicht-homologen Endverknüpfung (NHEJ) hin. [ 6 ] WRN interagiert außerdem physikalisch mit dem wichtigen NHEJ-Faktor X4L4 ( XRCC4 - DNA-Ligase-4- Komplex). [ 7 ] X4L4 stimuliert die Exonukleaseaktivität von WRN, was wahrscheinlich die DNA-Endverarbeitung vor der finalen Ligation durch X4L4 erleichtert. [ 7 ]

WRN scheint auch eine Rolle bei der Auflösung von Rekombinationszwischenstrukturen während der homologen Rekombinationsreparatur (HRR) von DNA-Doppelstrangbrüchen zu spielen. [ 6 ]

WRN ist an einem Komplex mit den Proteinen RAD51 , RAD54, RAD54B und ATR beteiligt, der den Rekombinationsschritt während der Reparatur von DNA-Quervernetzungen zwischen den Strängen durchführt . [ 8 ]

Es wurden Belege dafür vorgelegt, dass WRN eine direkte Rolle bei der Reparatur von durch Methylierung verursachten DNA-Schäden spielt . Der Prozess beinhaltet wahrscheinlich die Helikase- und Exonukleaseaktivitäten von WRN, die zusammen mit der DNA-Polymerase beta bei der Basenexzisionsreparatur langer Bereiche wirken . [ 9 ]

Es wurde festgestellt, dass WRN eine spezifische Rolle bei der Prävention oder Reparatur von DNA-Schäden spielt, die durch chronischen oxidativen Stress verursacht werden , insbesondere in sich langsam teilenden Zellen. [ 10 ] Dieser Befund legte nahe, dass WRN eine wichtige Rolle bei der Behandlung oxidativer DNA-Schäden spielen könnte, die dem normalen Alterungsprozess zugrunde liegen [ 10 ] (siehe DNA-Schadenstheorie des Alterns ).

BLM-Helikopter

Zellen von Menschen mit Bloom-Syndrom reagieren empfindlich auf DNA-schädigende Substanzen wie UV-Strahlung und Methylmethansulfonat [ 11 ], was auf eine mangelhafte DNA-Reparaturfähigkeit hinweist .

Die Bäckerhefe Saccharomyces cerevisiae kodiert ein Ortholog des Bloom-Syndrom-Proteins (BLM), das als Sgs1 (Slow growth suppressor 1) bezeichnet wird. Sgs1(BLM) ist eine Helikase, die an der homologen Rekombinationsreparatur von DNA-Doppelstrangbrüchen beteiligt ist. Die Sgs1(BLM)-Helikase scheint ein zentraler Regulator der meisten Rekombinationsereignisse während der Meiose von S. cerevisiae zu sein . [ 12 ] Während der normalen Meiose steuert Sgs1(BLM) die Rekombination in Richtung der alternativen Bildung von entweder frühen Nicht-Crossovers oder Holliday-Junction -Molekülen, wobei letztere anschließend zu Crossovers aufgelöst werden . [ 12 ]

In der Ackerschmalwand (Arabidopsis thaliana) wirken Homologe der Sgs1(BLM)-Helikase als wichtige Barrieren für die meiotische Crossover-Bildung. [ 13 ] Man geht davon aus, dass diese Helikasen den eindringenden Strang verdrängen und so dessen Hybridisierung mit dem anderen 3'-Überhang des Doppelstrangbruchs ermöglichen. Dies führt durch einen Prozess namens syntheseabhängiges Strangannealing (SDSA) zur Bildung von Rekombinanten ohne Crossover (siehe Wikipedia-Artikel „ Genetische Rekombination “). Schätzungsweise werden nur etwa 5 % der Doppelstrangbrüche durch Crossover-Rekombination repariert. Sequela-Arnaud et al. [ 13 ] vermuteten, dass die Anzahl der Crossover aufgrund der langfristigen Kosten der Crossover-Rekombination begrenzt ist, d. h. aufgrund der Zerstörung von durch natürliche Selektion in der Vergangenheit entstandenen vorteilhaften Allelkombinationen .

RECQL4 Helikoptergehäuse

Bei Menschen mit Rothmund-Thomson-Syndrom und der Keimbahnmutation im RECQL4- Gen zeigen sich verschiedene klinische Merkmale beschleunigter Alterung . Dazu gehören Hautatrophie und Pigmentveränderungen, Alopezie , Osteopenie , Katarakte und ein erhöhtes Krebsrisiko . [ 14 ] Auch RECQL4-mutierte Mäuse weisen Merkmale beschleunigter Alterung auf. [ 15 ]

RECQL4 spielt eine entscheidende Rolle bei der DNA-Endreparatur, dem ersten Schritt der homologen Rekombination (HR)-abhängigen Reparatur von Doppelstrangbrüchen. [ 16 ] Bei einem Mangel an RECQL4 sind die HR-vermittelte Reparatur und die 5'-Endreparatur in vivo stark reduziert. RECQL4 scheint auch für andere Formen der DNA-Reparatur, wie die nicht-homologe Endverknüpfung , die Nukleotidexzisionsreparatur und die Basenexzisionsreparatur , notwendig zu sein . [ 14 ] Der Zusammenhang zwischen einer mangelhaften RECQL4-vermittelten DNA-Reparatur und beschleunigter Alterung steht im Einklang mit der DNA-Schadenstheorie des Alterns .

Siehe auch

Referenzen

  1. Bernstein DA, Keck JL (Juni 2003). „Domänenkartierung von Escherichia coli RecQ definiert die Rollen konservierter N- und C-terminaler Regionen in der RecQ-Familie“ . Nucleic Acids Res . 31 (11): 2778–85 . doi : 10.1093 / nar/gkg376 . PMC  156711. PMID  12771204 .
  2. ^ Cobb JA, Bjergbaek L, Gasser SM (Oktober 2002). „RecQ-Helikasen: im Zentrum der genetischen Stabilität“ . FEBS Lett . 529 (1): 43–48 . Bibcode : 2002FEBSL.529...43C . doi : 10.1016/S0014-5793(02)03269-6 . PMID 12354611 . 
  3. ^ Kaneko H, Fukao T, Kondo N (2004). „Die Funktion der RecQ-Helikase-Genfamilie (insbesondere BLM) bei der DNA-Rekombination und -Verknüpfung“. Adv. Biophys . 38 : 45–64 . doi : 10.1016/S0065-227X(04)80061-3 . PMID 15493327 . 
  4. ^ Ouyang KJ, Woo LL, Ellis NA (2008). „Homologe Rekombination und Aufrechterhaltung der Genomintegrität: Krebs und Altern durch das Prisma menschlicher RecQ-Helikasen“. Mech. Ageing Dev . 129 ( 7–8 ): 425–40 . doi : 10.1016/j.mad.2008.03.003 . PMID 18430459 . 
  5. ^ Hanada K, Hickson ID (September 2007). „Molekulargenetik von RecQ-Helikase-Erkrankungen“ . Cell . Mol. Life Sci . 64 (17): 2306–2322 . doi : 10.1007/s00018-007-7121-z . PMC 11136437. PMID 17571213 .  
  6. ^ a b Thompson LH, Schild D (2002). „Rekombinations-DNA-Reparatur und menschliche Krankheiten“ . Mutat. Res . 509 ( 1–2 ): 49–78 . Bibcode : 2002MRFMM.509...49T . doi : 10.1016/s0027-5107(02)00224-5 . PMID 12427531 . 
  7. ^ a b Kusumoto R, Dawut L, Marchetti C, Wan Lee J, Vindigni A, Ramsden D, Bohr VA (2008). „Werner-Protein kooperiert mit dem XRCC4-DNA-Ligase-IV - Komplex bei der Endprozessierung“ . Biochemistry . 47 (28): 7548–56 . doi : 10.1021/bi702325t . PMC 2572716. PMID 18558713 .  
  8. ^ Otterlei M, Bruheim P, Ahn B, Bussen W, Karmakar P, Baynton K, Bohr VA (2006). „Das Werner-Syndrom-Protein ist an einem Komplex mit RAD51, RAD54, RAD54B und ATR als Reaktion auf ICL-induzierten Replikationsstopp beteiligt . “ J. Cell Sci . 119 (Pt 24): 5137–46 . doi : 10.1242/jcs.03291 . PMID 17118963 . 
  9. ^ Harrigan JA, Wilson DM, Prasad R, Opresko PL, Beck G, May A, Wilson SH, Bohr VA (2006). „Das Werner-Syndrom-Protein ist an der Basenexzisionsreparatur beteiligt und interagiert mit der DNA-Polymerase β“ . Nucleic Acids Res . 34 (2): 745–54 . doi : 10.1093 / nar/gkj475 . PMC 1356534. PMID 16449207 .  
  10. ^ a b Szekely AM, Bleichert F, Nümann A, Van Komen S, Manasanch E, Ben Nasr A, Canaan A, Weissman SM (2005). „Werner-Protein schützt nicht-proliferierende Zellen vor oxidativem DNA-Schaden“ . Mol . Cell. Biol . 25 (23): 10492–506 . doi : 10.1128/MCB.25.23.10492-10506.2005 . PMC 1291253. PMID 16287861 .  
  11. ^ So S, Adachi N, Lieber MR, Koyama H (2004). „Genetische Interaktionen zwischen BLM und DNA-Ligase IV in menschlichen Zellen“ . J. Biol. Chem . 279 (53): 55433–42 . doi : 10.1074/jbc.M409827200 . PMID 15509577 . 
  12. ^ De Muyt A, Jessop L, Kolar E, Sourirajan A, Chen J, Dayani Y, Lichten M (2012). „Das BLM-Helikase-Ortholog Sgs1 ist ein zentraler Regulator des meiotischen Rekombinations-Zwischenstoffwechsels . “ Mol. Zelle . 46 (1): 43–53 . doi : 10.1016/j.molcel.2012.02.020 . PMC 3328772 . PMID 22500736 .  
  13. ^ Séguéla - Arnaud M, Crismani W, Larchevêque C, Mazel J, Froger N, Choinard S, Lemhemdi A, Macaisne N, Van Leene J, Gevaert K, De Jaeger G, Chelysheva L, Mercier R (2015). „Mehrere Mechanismen begrenzen meiotische Crossovers: TOP3α und zwei BLM-Homologe antagonisieren Crossovers parallel zu FANCM“ . Proz. Natl. Acad. Wissenschaft. USA . 112 (15): 4713– 8. Bibcode : 2015PNAS..112.4713S . doi : 10.1073/pnas.1423107112 . PMC 4403193 . PMID 25825745 .  
  14. ^ a b Lu L, Jin W, Wang LL (2017). „Altern beim Rothmund-Thomson-Syndrom und verwandten RECQL4-Genstörungen“. Ageing Res. Rev. 33 : 30–35 . doi : 10.1016 /j.arr.2016.06.002 . PMID 27287744 . 
  15. ^ Lu H, Fang EF, Sykora P, Kulikowicz T, Zhang Y, Becker KG, Croteau DL, Bohr VA (2014). „Durch RECQL4-Dysfunktion induzierte Seneszenz trägt zu den Merkmalen des Rothmund-Thomson-Syndroms bei Mäusen bei“ . Cell Death Dis . 5 (5): e1226. doi : 10.1038/cddis.2014.168 . PMC 4047874. PMID 24832598 .  
  16. ^ Lu H, Shamanna RA, Keijzers G, Anand R, Rasmussen LJ, Cejka P, Croteau DL, Bohr VA (2016). „RECQL4 fördert die DNA-Endresektion bei der Reparatur von DNA-Doppelstrangbrüchen“ . Zellvertreter . 16 (1): 161– 73. doi : 10.1016/j.celrep.2016.05.079 . PMC 5576896 . PMID 27320928 .  

Weiterführende Literatur

  • Skouboe C, Bjergbaek L, Andersen AH (2005). „Genominstabilität als Ursache von Alterung und Krebs: Implikationen von RecQ-Helikasen“. Signal Transduction . 5 (3): 142–151 . doi : 10.1002/sita.200400052 .
  • Laursen LV, Bjergbaek L, Murray JM, Andersen AH (2003). „RecQ-Helikasen und Topoisomerase III bei Krebs und Altern“. Biogerontologie . 4 (5): 275– 87. doi : 10.1023/A:1026218513772 . PMID  14618025 .