tomviz ist eine Open-Source -Softwareplattform für reproduzierbare volumetrische Visualisierung und Datenverarbeitung. [ 1 ] Die Plattform ist für ein breites Spektrum wissenschaftlicher Anwendungen konzipiert, insbesondere aber für die hochauflösende Elektronentomographie . Sie bietet Funktionen zur Ausrichtung und Rekonstruktion von Nanomaterialien . Die tomviz-Plattform ermöglicht die grafische Analyse von 3D-Datensätzen und enthält zudem Python- , NumPy- und SciPy- Tools für die fortgeschrittene Datenverarbeitung und -analyse. Die aktuelle Version ist 1.10.0. [ 2 ]

Im Jahr 2022 wurde die Plattform Tomviz eingesetzt, um die 3D-Visualisierung von Proben während eines Elektronen- oder Kryo-Elektronen-Tomographie-Experiments zu ermöglichen. [ 3 ] Tomviz basiert auf einer Multithread-Datenanalyse-Pipeline und ermöglicht dynamische Visualisierungen, die sich mit der Erfassung neuer Daten oder dem Fortschritt von Rekonstruktionsalgorithmen aktualisieren. Wissenschaftler können die 3D-Struktur der Probe interaktiv parallel zur tomographischen Rekonstruktion nach oder während eines Experiments analysieren.

Volumetrische Visualisierung von Nanowürfeln durch Forscher der Cornell University. Die nanoskalige Rekonstruktion wurde mit der 3D-Analyseplattform tomviz visualisiert.

Referenzen

  1. ^ Hovden, Robert (22. September 2014). „Visualisierung von Nanotechnologie in 3D mit Open-Source-Software“ . OpenSource.com.
  2. ^ „Tomviz-Downloadseite“ . Kitware. 8. Februar 2021.
  3. ^ Hovden, Robert (1. August 2022). „ Echtzeit-3D-Analyse während der Elektronentomographie mit tomviz“ . Nature Communications . 13 (1): 4458. arXiv : 2208.01850 . Bibcode : 2022NatCo..13.4458S . doi : 10.1038/ s41467-022-32046-0 . PMC 9343612. PMID 35915070. S2CID 251254217 .