Vijay S. Pande

Vijay Satyanand Pande ist ein trinidadisch-amerikanischer Wissenschaftler und Risikokapitalgeber . Pande ist vor allem für die Leitung des Forschungsprojekts Folding@home bekannt, das sich mit verteiltem Rechnen und der Proteinfaltung befasst . ^{[ 1 ]} Seine Forschungsschwerpunkte liegen auf verteiltem Rechnen und der Computermodellierung in der Mikrobiologie sowie auf der Verbesserung von Computersimulationen zur Wirkstoffbindung , zum Proteindesign und zu synthetischen biomimetischen Polymeren . ^{[ 2 ] [ 3 ]} Er war Gründer und geschäftsführender Gesellschafter des Bio + Health-Fonds der Risikokapitalgesellschaft a16z . ^{[ 3 ]} Aktuell ist Pande Mitgründer und geschäftsführender Gesellschafter der Risikokapitalgesellschaft VZVC. ^{[ 4 ]}

Pande absolvierte 1988 die Langley High School und wuchs in McLean, Virginia, auf . Bereits als Schüler belegte er beim Westinghouse Science Talent Search 1988 den vierten Platz für sein Projekt zur Simulation weltraumgestützter Raketenabwehr. ^{[ 2 ]} Seine Analyse ergab, dass „zum Schutz vor 2.400 sowjetischen Raketen 8.000 mit Laserwaffen ausgestattete Satelliten erforderlich wären“ – eine Kritik an Ronald Reagans Strategischer Verteidigungsinitiative (SDI). ^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

Nach seinem Schulabschluss 1988 arbeitete Pande kurzzeitig beim Videospielentwicklungsunternehmen Naughty Dog . Dort war er für die PC- und Amiga- Portierungen des Apple-IIGS -Spiels „ Keef the Thief “ (1989) zuständig und wirkte als Programmierer und Designer am Sega-Genesis -Spiel „Rings of Power“ (1992) mit. ^{[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]} Während seines Studiums am MIT und der Zeit, als Naughty Dog seinen Sitz in Boston hatte , verkörperte er Gulab Jamun, einen geheimen Charakter im 3DO -Kampfspiel „Way of the Warrior“ (1994). ^{[ 11 ] [ 12 ]}

Er ist mit Lara Pande verheiratet und hat drei Töchter. Die Familie hegt eine Vorliebe für Katzen. ^{[ 1 ] [ 13 ]}

Pande ist außerordentlicher Professor für Strukturbiologie , Informatik, Biophysik und Chemie an der Stanford University . Zuvor war er Henry-Dreyfus -Professor für Chemie sowie Professor für Strukturbiologie und Informatik . Er war außerdem Leiter des Biophysikprogramms. ^{[ 14 ]}

Im Jahr 2015 wurde Pande der neunte Generalpartner bei Andreessen Horowitz (a16z), wo er den firmeneigenen Bio + Health Fund gründete ^{[ 15 ]} , der in Life Sciences und Gesundheitswesen mit einem verwalteten Vermögen von über 3 Milliarden US-Dollar investiert ^{[ 16 ]} . Im Dezember 2015 gab er die Führungsposition auf und wechselte in eine KI-Funktion innerhalb des Unternehmens ^{[ 17 ] .}

Pande war Mitglied der Aufsichtsräte von Apeel Sciences , Bayesian Health, BioAge Labs, Citizen, Devoted Health, Freenome, Insitro, Nautilus Biotechnology, Nobell, Omada Health, Q.bio, Function Health Board, Slingshot AI und Scribe Therapeutics, einem von der Nobelpreisträgerin von 2020 , Jennifer Doudna , mitgegründeten CRISPR- Unternehmen . Er war außerdem Gründer und Berater von Startups im Silicon Valley . ^{[ 18 ]}

Im Jahr 2025 verließ Pande Andreessen Horowitz, um gemeinsam mit dem Startup-Investor Zack Werner VZVC zu gründen, eine Risikokapitalgesellschaft im Silicon Valley, die sich auf KI-gestützte Gesundheitsversorgung spezialisiert hat. ^{[ 4 ]} VZVC investiert in technologiebasierte Healthcare-Startups, die sich mit langjährigen Herausforderungen in den Bereichen Versorgungsqualität, Zugang und Kosten befassen, mit einem besonderen Fokus auf verbraucherorientierte Gesundheitsdienstleistungen und präventive Diagnostik.

Pande hat unter anderem für Time , ^{[ 19 ]} STAT News , ^{[ 20 ]} Fortune , ^{[ 21 ]} Scientific American und die New York Times , ^{[ 22 ]} geschrieben .

Im Jahr 2014 war Pande Mitbegründer von Globavir Biosciences, einem Start-up-Unternehmen im Bereich Infektionskrankheiten, das sich mit der Bekämpfung von Antibiotikaresistenzen in Industrieländern sowie mit dem Bedarf an Lösungen für Virusinfektionen weltweit, einschließlich Ebola und Denguefieber, befasst . ^{[ 15 ] [ 23 ]}

Pande gründete das Pande-Labor an der Stanford University. Das Labor vereint Forscher aus vielen Fachbereichen, darunter Chemie, Informatik, Strukturbiologie, Physik , Biophysik und Biochemie . ^{[ 14 ]}

Das Labor leistete einen entscheidenden Beitrag zur Weiterentwicklung von Echtzeitsimulationen von Biomolekülen. Seine Arbeit wurde 2002 in der TR100-Liste der MIT Technology Review für die Anwendung verteilter Rechenverfahren zur Lösung komplexer Faltungssequenzen hervorgehoben: „Seit dem Projektstart im Oktober 2000 haben weltweit rund 75.000 Freiwillige dazu beigetragen, erstmals das vollständige Faltungsverhalten von fünf wichtigen Proteinen zu simulieren.“ ^{[ 24 ] [ 25 ]}

Pande ist der Gründer des Forschungsprojekts Folding@home. ^{[ 14 ]} Die Proteinfaltungs-Computersimulationen des Folding@home-Projekts sollen quantitativ mit realen experimentellen Ergebnissen vergleichbar sein. Die Methode, die diese Ergebnisse ermöglicht, wurde in der Computerbiologie als „Heiliger Gral“ bezeichnet . ^{[ 26 ] [ 27 ]} Folding@home wurde 2007 vom Guinness-Buch der Rekorde als leistungsstärkstes verteiltes Computernetzwerk der Welt anerkannt. ^{[ 28 ]}

• Im Jahr 2002 wurde er zum Frederick E. Terman Fellow ernannt und von der MIT Technology Review in die TR100-Liste der 100 innovativsten Köpfe unter 35 Jahren aufgenommen . Im darauffolgenden Jahr erhielt er den Henry and Camille Dreyfus Teacher-Scholar Award. ^{[ 3 ]}
• Im Jahr 2004 erhielt er von Global Indus Technovators den Technovator Award in der Kategorie Biotechnologie/Medizin/Gesundheitswesen. ^{[ 29 ]}
• Im Jahr 2006 wurde Pande von der Protein Society mit dem Irving Sigal Young Investigator Award ausgezeichnet .
• Im Jahr 2008 wurde er zum „Netxplorateur des Jahres 2008“ ernannt. ^{[ 29 ]} Ebenfalls im Jahr 2008 erhielt er den Thomas-Kuhn -Paradigmenwechselpreis und die Fellowship der American Physical Society . ^{[ 2 ]}
• Pande erhielt 2012 den Michael-und-Kate-Bárány-Preis für die Entwicklung von Computermodellen für Proteine ​​und RNA . ^{[ 2 ] [ 29 ]}
• Im Jahr 2015 erhielt Pande den DeLano-Preis für Computergestützte Biowissenschaften sowie den Camille-und-Henry-Dreyfus-Lehrstuhl für Chemie. ^{[ 30 ] [ 31 ]}

Vijay Pande ist Autor bzw. Co-Autor von über 300 begutachteten wissenschaftlichen Artikeln aus den Bereichen Computerchemie, Biophysik, Molekulardynamik und maschinelles Lernen in der Biologie. Nachfolgend eine Auswahl seiner wichtigsten Publikationen:

• Feinberg, EN, Sur, D., Wu, Z., Husic, BE, Mai, H., Li, Y., ... & Pande, VS (2018). „PotentialNet zur Vorhersage molekularer Eigenschaften.“ ACS Central Science , 4 (11), 1520–1530. In dieser Arbeit wurde ein neuartiges Graph-Convolutional-Neural-Network-Framework (GNN) – PotentialNet – zur Vorhersage molekularer Eigenschaften wie Protein-Ligand-Bindungsaffinitäten vorgestellt. Die Methode zeigte überlegene Leistung in pharmazeutischen Anwendungen und wurde unter anderem von Merck übernommen.

• Feinberg, EN, Tseng, H., Husic, BE, Mai, H., Li, Y., Cox, S., ... & Pande, VS (2020). „Verbesserte Vorhersage von ADMET-Eigenschaften mit Graph Convolutional Networks.“ Journal of Medicinal Chemistry , 63 (16), 8835–8848. Aufbauend auf PotentialNet erzielte diese Arbeit eine von den Autoren als „beispiellos“ bezeichnete Genauigkeit bei der Vorhersage von ADMET-Eigenschaften (Absorption, Distribution, Metabolismus, Elimination und Toxizität) und übertraf damit traditionelle Ansätze des maschinellen Lernens wie Random-Forest-Modelle.

• Shirts, M., & Pande, VS (2000). „Computing: Screen savers of the world unite!“ Science , 290 (5498), 1903–1904. Dieser Übersichtsartikel legte die theoretischen Grundlagen für großflächiges verteiltes Rechnen in der Molekularbiologie und schlug die Verwendung von handelsüblicher Hardware zur Aufteilung massiver Rechenaufgaben vor – eine Vision, die später mit Folding@home verwirklicht wurde.

• Bowman, GR, Voelz, VA & Pande, VS (2011). „Die Komplexität der Proteinfaltung zähmen.“ Current Opinion in Structural Biology , 21 (1), 4–11. Dieser Übersichtsartikel fasst die Fortschritte bei Markov-Zustandsmodellen (MSMs) zur Simulation der Proteinfaltung über lange Zeiträume zusammen. Pandes Arbeitsgruppe gehörte zu den ersten, die demonstrierten, wie MSMs biologisch relevante Erkenntnisse aus groß angelegten Molekülsimulationen gewinnen können.

• Dror, RO, Dirks, RM, Grossman, JP, Xu, H., Shaw, DE & Pande, VS (2012). „Biomolekulare Simulation: Ein computergestütztes Mikroskop für die Molekularbiologie.“ Annual Review of Biophysics , 41 , 429–452. Dieser gemeinsam mit Forschern von DE Shaw Research verfasste Artikel untersucht, wie molekulare Simulationen die Strukturbiologie revolutionieren, indem sie die Modellierung dynamischer Prozesse wie der Rezeptor-Ligand-Bindung und allosterischer Übergänge ermöglichen.

• Kohlhoff, KJ, Shukla, D., Lawrenz, M., Bowman, GR, Konerding, DE, Belov, D., ... & Pande, VS (2014). „Cloudbasierte Simulationen auf Google Exacycle zeigen Ligandenmodulation von GPCR-Aktivierungswegen.“ Nature Chemistry , 6 (1), 15–21. Im Rahmen des Stanford/NIH/Google Exacycle-Projekts präsentierte diese Arbeit eine der ersten atomistischen Simulationen der Aktivierung von G-Protein-gekoppelten Rezeptoren (GPCR) über 2 Millisekunden – eine Zeitspanne, die als „eine nahezu unendliche chemische Reaktionszeit“ beschrieben wird – und enthüllte intermediäre Konformationszustände, die für das rationale Wirkstoffdesign von entscheidender Bedeutung sind.

• Ramsundar, Bharath (2019). Deep Learning für die Lebenswissenschaften: Anwendung von Deep Learning in Genomik, Mikroskopie, Wirkstoffforschung und mehr . Herausgegeben von Peter Eastman, Patrick Walters und Vijay Pande (1. Auflage). O'Reilly Media , Inc. ISBN 978-1-4920-3980-8
• Pande, Vijay (2012). Grundlagen der Physikalischen Chemie (Zweite Auflage). CreateSpace Independent Publishing Platform. ISBN 978-1-4810-2733-5
• Einführung in Markov-Zustandsmodelle und ihre Anwendung in der Molekularsimulation über lange Zeiträume . Gregory R. Bowman, Vijay Pande, Frank Noé. Dordrecht. 2014. Springer . ISBN 978-94-007-7606-7
• Grosberg, A. IU. (1994). Statistische Physik der Makromoleküle . AR Khokhlov. New York: AIP Press . ISBN 1-56396-071-0

• Profil des Generalpartners von Andreessen Horowitz
• Podcast-Interview der Times of London
• Folding@home-Website
• Professor Pandes Google Scholar-Seite
• Interview mit Pande, archiviert am 19.10.2016 in der Wayback Machine
• Vijay S. Pande bei MobyGames