Computational chemistry

Ultra-Large-Scale Docking ( Ultra-LSD ) ist ein Verfahren zur Untersuchung von Protein-Ligand-Interaktionen und zum virtuellen Screening .

In der theoretischen und computergestützten Chemie ist ein Basissatz eine Menge von Funktionen (sogenannte Basisfunktionen ), die dazu verwendet wird, die elektronische Wellenfunktion in der Hartree-Fock-Methode oder der

Critical Assessment of Structure Prediction ( CASP ), auch bekannt als Critical Assessment of Protein Structure Prediction , ist ein weltweites, gemeinschaftliches Experiment zur Vorhersage von Proteinstrukturen, das

Das CCP4-Dateiformat wurde 1979 im Rahmen des Collaborative Computational Project Number 4 (CCP4) entwickelt. Es dient als Standard für die Elektronendichte in der Röntgenkristallographie und Kryo-Elektronenmikroskopie.

Chemometrie ist die Wissenschaft der Informationsgewinnung aus chemischen Systemen mittels datengetriebener Methoden.

Im Bereich der Molekülmodellierung ist Docking eine Methode, die die bevorzugte Orientierung eines Moleküls relativ zu einem zweiten vorhersagt, wenn ein Ligand und ein Zielmolekül einen stabilen Komplex bilden .

In der Atomphysik und Quantenchemie bezeichnet die Elektronenkonfiguration die Verteilung der Elektronen eines Atoms oder Moleküls (oder einer anderen physikalischen Struktur) auf atomare oder Molekülorbitale .

Ein quantenmechanisches System oder Teilchen , das gebunden ist – also räumlich begrenzt –, kann nur bestimmte diskrete Energiewerte, sogenannte Energieniveaus , annehmen .

In der theoretischen Chemie ist ein Energieprofil die theoretische Darstellung einer chemischen Reaktion oder eines chemischen Prozesses als ein einziger energetischer Pfad, auf dem die Reaktanten in Produkte umgewandelt

In der Computerchemie beschreibt die Fukui-Funktion (auch Grenzorbitalfunktion genannt) die Elektronendichte in einem Grenzorbital infolge einer geringfügigen Änderung der Gesamtelektronenzahl.

In der Quantenmechanik ist der Hamiltonoperator eines Systems ein Operator , der der Gesamtenergie dieses Systems entspricht, einschließlich kinetischer und potenzieller Energie .

Die Computational Chemistry List (CCL) wurde am 11. Januar 1991 als unabhängiges elektronisches Forum für Chemieforscher und -lehrende aus aller Welt gegründet.

Dies ist eine Liste von Softwareprogrammen für die Computerchemie , die für elektronische Strukturrechnungen , die Vorhersage molekularer Eigenschaften und verwandte Simulationen verwendet werden.

Lokalisierte Molekülorbitale sind Molekülorbitale , die auf einen begrenzten räumlichen Bereich eines Moleküls konzentriert sind, beispielsweise auf eine bestimmte Bindung oder ein freies Elektronenpaar eines bestimmten

Metadynamik (MTD; auch abgekürzt als METAD oder MetaD) ist eine Computersimulationsmethode in der Computerphysik , -chemie und -biologie .

Slater-Orbitale ( STOs ) oder Slater-Funktionen (STFs) sind Funktionen, die in der Molekülorbitalmethode der linearen Kombination von Atomorbitalen als Atomorbitale verwendet werden . Sie sind nach dem Physiker John C.

Quantitative Struktur-Wirkungsbeziehungsmodelle ( QSAR- Modelle) sind Regressions- oder Klassifikationsmodelle, die in den chemischen und biologischen Wissenschaften sowie im Ingenieurwesen Anwendung finden .

In der Chemie ist eine Reaktionskoordinate eine abstrakte, eindimensionale Koordinate, die den Fortschritt entlang eines Reaktionswegs darstellt.

In der Atomphysik ist eine Teilladung (oder Nettoladung des Atoms ) ein nicht- ganzzahliger Ladungswert, gemessen in Elementarladungseinheiten .

Die Tensor Contraction Engine (TCE) ist ein Compiler für eine domänenspezifische Sprache, mit der Chemiker Berechnungen in einer höheren, an Mathematica angelehnten Sprache spezifizieren können.

Dies ist eine Liste von Computerprogrammen, die überwiegend für molekularmechanische Berechnungen verwendet werden.

In der Computerchemie werden Wassermodelle verwendet, um Wassercluster, flüssiges Wasser und wässrige Lösungen mit explizitem Lösungsmittel zu simulieren und thermodynamisch zu berechnen , häufig mithilfe von

Das „ Journal of Chemical Information and Modeling“ ist eine von der American Chemical Society herausgegebene , begutachtete wissenschaftliche Fachzeitschrift .