Dermcidin ist ein Protein aus 110 Aminosäuren, das beim Menschen durch das DCD- Gen kodiert wird . [ 3 ] [ 4 ] Das vollständige Protein produziert abgeleitete Peptide wie den Proteolyse-induzierenden Faktor ( PIF ) und andere antimikrobielle Peptide . [ 4 ] Diese werden von den ekkrinen Schweißdrüsen des Menschen als Teil der angeborenen Immunabwehr auf die Haut abgegeben. PIF ist an der Muskelproteolyse beteiligt. [ 4 ]
Funktion
Dermcidin ist ein sezerniertes Protein, das anschließend in reife Peptide mit unterschiedlichen biologischen Aktivitäten prozessiert wird. Das C-terminale Peptid wird konstitutiv im Schweiß exprimiert und besitzt antibakterielle und antimykotische Eigenschaften. Das N-terminale Peptid, auch bekannt als diffusionsfähiges Überlebens-Evasionspeptid, fördert das Überleben von Nervenzellen unter starkem oxidativem Stress . Eine glykosylierte Form des N-terminalen Peptids könnte mit Kachexie (Muskelschwund) bei Krebspatienten in Zusammenhang stehen . [ 4 ]
Überlebensfluchtpeptid Antimikrobielles Peptid
YDPEAASAPGSGNPCHEASAAQKENAGEDPGLARQAPKPRKQR SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESVGKGAVHDVKDVLDSVL
Das C-terminale Vorläuferprotein DCD-1L ist ein Peptid aus 48 Aminosäuren, das in Lösung eine partielle Helizität aufweist, wie die Strukturaufklärung mittels NMR- und CD-Spektroskopie belegt. Das vollständige Vorläuferprotein wird durch unbekannte Proteasen im menschlichen Schweiß zu mehreren kürzeren Peptiden prozessiert, die eine variable antimikrobielle Aktivität zeigen. Diese Peptide werden nach ihrem C-terminalen Aminosäuretriplett und ihrer Aminosäurenlänge benannt. Ein solches aktives Peptid ist SSL25, das im Vergleich zu DCD-1L eine doppelt so hohe Aktivität gegen E. coli aufweist. [ 5 ]
DCD-1L SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESVGKGAVHDVKDVLDSVL DCD-1 SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESVGKGAVHDVKDVLDSV SSL25 SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDA
Mechanismus
Die Kristallstruktur von Dermcidin wurde in Lösung aufgeklärt und zeigte ein hexameres Helixbündel, dessen Struktur durch die Bindung von Zn²⁺ -Ionen vermittelt wird. [ 6 ] Molekulardynamiksimulationen zeigten , dass dieses Bündel in Membranen einen geneigten Kanal bildet. Ein daraus abgeleiteter Mechanismus der antimikrobiellen Wirkung beruht auf der Entkopplung des Ionengradienten über biologische Membranen . Dies wird durch experimentelle Beobachtungen einer spannungsabhängigen Depolarisation von Lipiddoppelschichten gestützt .
Referenzen
- ^ a b c GRCh38: Ensembl Release 89: ENSG00000161634 – Ensembl , Mai 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“ . National Center for Biotechnology Information, US National Library of Medicine .
- ^ Schittek B, Hipfel R, Sauer B, Bauer J, Kalbacher H, Stevanovic S, Schirle M, Schroeder K, Blin N, Meier F, Rassner G, Garbe C (Nov. 2001). „Dermicidin: ein neuartiges humanes antibiotisches Peptid, das von Schweißdrüsen sezerniert wird“. Nat Immunol . 2 (12): 1133–7 . doi : 10.1038/ni732 . PMID 11694882. S2CID 26126901 .
- ^ a b c d „Entrez-Gen: DCD-Dermicidin“ .
- ^ Baechle D, Flad T, Cansier A, et al. (2006). „Cathepsin D ist im menschlichen ekkrinen Schweiß vorhanden und an der postsekretorischen Prozessierung des antimikrobiellen Peptids DCD-1L beteiligt“ . J. Biol. Chem . 281 (9): 5406–15 . doi : 10.1074/jbc.M504670200 . PMID 16354654 .
- ^ PDB : 2YMK Song , Chen, Weichbrodt, Conrad, Salnikov, Evgeniy S, Dynowski, Marek, Forsberg, Björn O, Bechinger, Burkhard, Steinem, Claudia, de Groot, Bert L, Zachariae, Ulrich, Zeth, Kornelius (Feb 2013). „Kristallstruktur und Funktionsmechanismus eines humanen antimikrobiellen Membrankanals“ . PNAS . 110 (12): 4586–91 . Bibcode : 2013PNAS..110.4586S . doi : 10.1073 / pnas.1214739110 . PMC 3607029. PMID 23426625 .
Weiterführende Literatur
- Todorov P, Cariuk P, McDevitt T, et al. (1996). „Charakterisierung eines Kachexie-Faktors bei Krebs“. Nature . 379 ( 6567): 739–42 . Bibcode : 1996Natur.379..739T . doi : 10.1038/379739a0 . PMID 8602222. S2CID 4331928 .
- Todorov PT, Deacon M, Tisdale MJ (1997). „Strukturanalyse eines von Tumoren produzierten sulfatierten Glykoproteins, das den Abbau von Muskelproteinen einleiten kann“ . J. Biol. Chem . 272 (19): 12279–88 . doi : 10.1074/jbc.272.19.12279 . PMID 9139670 .
- Cunningham TJ, Hodge L, Speicher D, et al. (1998). „Identifizierung eines überlebensfördernden Peptids im Medium von oxidativ gestressten Zelllinien des Nervensystems“ . J. Neurosci . 18 (18): 7047–60 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.18-18-07047.1998 . PMC 6793258. PMID 9736629 .
- Cunningham TJ, Jing H, Wang Y, Hodge L (2000). „Calreticulin-Bindung und andere biologische Aktivitäten des Überlebenspeptids Y-P30 einschließlich der Effekte einer systemischen Behandlung von Ratten“. Exp . Neurol . 163 (2): 457–68 . doi : 10.1006/exnr.2000.7390 . PMID 10833321. S2CID 22279800 .
- Cunningham TJ, Jing H, Akerblom I, et al. (2002). „Identifizierung der humanen cDNA für das neue Überlebens-/Ausweichpeptid (DSEP): In-vitro- und In-vivo-Studien zur Überexpression durch neuronale Zellen“. Exp . Neurol . 177 (1): 32–39 . doi : 10.1006/exnr.2002.7979 . PMID 12429208. S2CID 11829104 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). „Generierung und erste Analyse von mehr als 15.000 vollständigen cDNA-Sequenzen von Mensch und Maus“ . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Porter D, Weremowicz S, Chin K, et al. (2003). „Ein neuronaler Überlebensfaktor ist ein Kandidaten-Onkogen bei Brustkrebs“ . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 100 (19): 10931–6 . Bibcode : 2003PNAS..10010931P . doi : 10.1073/pnas.1932980100 . PMC 196905. PMID 12953101 .
- Zhang Z, Henzel WJ (2005). „Vorhersage von Signalpeptiden basierend auf der Analyse experimentell verifizierter Spaltstellen“ . Protein Sci . 13 (10): 2819–24 . doi : 10.1110/ps.04682504 . PMC 2286551. PMID 15340161 .
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, et al. (2004). „Sequenzvergleich von menschlichen und Mausgenen zeigt eine homologe Blockstruktur in den Promotorregionen“ . Genome Res . 14 (9): 1711–8 . doi : 10.1101/gr.2435604 . PMC 515316. PMID 15342556 .
- Monitto CL, Dong SM, Jen J, Sidransky D (2005). „Charakterisierung eines humanen Homologs des Proteolyse-induzierenden Faktors und seine Rolle bei der Kachexie von Krebspatienten“ . Clin. Cancer Res . 10 (17): 5862–9 . doi : 10.1158/1078-0432.CCR-04-0435 . PMID 15355918 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). „Status, Qualität und Erweiterung des NIH-Projekts zur vollständigen cDNA-Sequenzierung: die Mammalian Gene Collection (MGC)“ . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Lai YP, Peng YF, Zuo Y, et al. (2005). „Funktionelle und strukturelle Charakterisierung von rekombinantem Dermicidin-1L, einem humanen antimikrobiellen Peptid“. Biochem. Biophys. Res. Commun . 328 (1): 243–50 . doi : 10.1016/j.bbrc.2004.12.143 . PMID 15670776 .
- Rieg S, Steffen H, Seeber S, et al. (2005). „Mangel an Dermicidin-abgeleiteten antimikrobiellen Peptiden im Schweiß von Patienten mit atopischer Dermatitis korreliert mit einer beeinträchtigten angeborenen Abwehr der menschlichen Haut in vivo“ . J. Immunol . 174 (12): 8003–10 . doi : 10.4049/jimmunol.174.12.8003 . PMID 15944307 .
- Watchorn TM, Dowidar N, Dejong CH, et al. (2006). „Der kachektische Mediator Proteolyse-induzierender Faktor aktiviert NF-κB und STAT3 in humanen Kupffer-Zellen und Monozyten“. Int. J. Oncol . 27 (4): 1105–111 . doi : 10.3892/ijo.27.4.1105 . PMID 16142329 .
- Lowrie AG, Wigmore SJ, Wright DJ, et al. (2006). „Dermicidin-Expression in Leberzellen verbessert das Überleben ohne N-Glykosylierung, erfordert jedoch Asparaginreste“ . Br . J. Cancer . 94 (11): 1663–71 . doi : 10.1038/sj.bjc.6603148 . PMC 2361319. PMID 16685272 .
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). „Großflächige Kartierung menschlicher Protein-Protein-Interaktionen mittels Massenspektrometrie“ . Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .
- Frum R, Busby SA, Ramamoorthy M, et al. (2007). „HDM2-Bindungspartner: Interaktion mit dem Translationselongationsfaktor EF1alpha“ . J. Proteome Res . 6 (4): 1410–7 . doi : 10.1021/pr060584p . PMC 4626875. PMID 17373842 .
- Lee Motoyama JP, Kim-Motoyama H, Kim P, et al. (2007). „Identifizierung von Dermicidin in menschlichem Schwangerschaftsgewebe und Charakterisierung seiner proteolytischen Aktivität“. Biochem. Biophys. Res. Commun . 357 (4): 828–33 . doi : 10.1016/j.bbrc.2007.03.112 . PMID 17448443 .
Externe Links
- Dermicidine in den Medical Subject Headings (MeSH) der US National Library of Medicine