Zeitschrift für Zellbiologie

Das Journal of Cell Biology ist eine von Fachkollegen begutachtete wissenschaftliche Zeitschrift, die von Rockefeller University Press herausgegeben wird .

Anfang der 1950er-Jahre begann eine kleine Gruppe von Biologen, die intrazelluläre Anatomie mithilfe der aufkommenden Technologie der Elektronenmikroskopie zu erforschen . Viele dieser Forscher waren am Rockefeller Institute of Medicine, dem Vorgängerinstitut der Rockefeller University , tätig. Im Zuge ihrer Forschungsarbeiten und deren Veröffentlichung waren sie enttäuscht von der begrenzten Qualität der Rasterbildwiedergabe in den damaligen Fachzeitschriften und frustriert über die restriktiven redaktionellen Richtlinien der bestehenden Zeitschriften hinsichtlich ihrer bildbasierten Ergebnisse. 1954 berief der Direktor des Rockefeller Institute, Detlev Bronk , ein Mittagessen ein, um die Gründung einer neuen Fachzeitschrift als Publikationsorgan für diese Art von Arbeiten zu erörtern. ^{[ 1 ]}

Die erste Ausgabe des „Journal of Biophysical and Biochemical Cytology“ erschien weniger als ein Jahr später, am 25. Januar 1955. Ein Abonnement kostete 15 US-Dollar pro Jahr. Zu den Herausgebern gehörten Richard S. Bear, H. Stanley Bennett, Albert L. Lehninger , George E. Palade , Keith R. Porter , Francis O. Schmitt , Franz Schrader und Arnold M. Seligman. Die Autorenrichtlinien beschrieben den thematischen Rahmen der Zeitschrift: „ Das ‚Journal of Biophysical and Biochemical Cytology‘ dient als gemeinsames Publikationsmedium für morphologische , biophysikalische und biochemische Untersuchungen an Zellen, ihren Bestandteilen und Produkten. Besonderes Augenmerk liegt auf Berichten zur zellulären Organisation auf kolloidaler und molekularer Ebene sowie auf Studien, die zytologische Informationen aus verschiedenen technischen Ansätzen integrieren.“ Da die Herausgeber einen einprägsameren Titel benötigten, benannten sie die Zeitschrift 1962 in „Journal of Cell Biology“ („JCB“) um.

In der Zeitschrift wurden zahlreiche bahnbrechende Entdeckungen veröffentlicht, darunter die ersten Beschreibungen zahlreicher zellulärer Funktionen und Strukturen, wie beispielsweise des Sekretionswegs ^{[ 2} ] ^{[ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] ,} der mitochondrialen ^{[ 8 ] [ 9 ]} und chloroplastären ^{[ 10 ]} DNA , der Mikrotubuli [ ^{11 ] [ 12 ]} , der Intermediärfilamente ^{[ 13 ]} , der Tight Junctions ^{[ 14 ] (} einschließlich Occludinen ^{[ 15 ]} und Claudinen ^{[ 16 ]} ), der Adhäsionsverbindungen ^{[ 14 ]} und der Cadherine ^{[ 17 ]} .

• 25. Januar 1955: Veröffentlichung der ersten Ausgabe des „ Journal of Biophysical and Biochemical Cytology“.
• Januar 1961 – Dezember 1983: Raymond Griffiths ist Chefredakteur.
• Januar 1962: Der Name der Zeitschrift wurde in The Journal of Cell Biology geändert .
• Januar 1984 – Dezember 1998 : Bernie Gilula ist Chefredakteur.
• 13. Januar 1997: Die erste Ausgabe von JCB wird online veröffentlicht.
• April 1997 – April 2007: Mike Rossner ist Chefredakteur.
• Januar 1999 – Dezember 2008: Ira Mellman ist Chefredakteur.
• Juli 2000: Autoren dürfen die endgültige, veröffentlichte PDF- Datei ihrer Artikel auf ihren eigenen Webseiten veröffentlichen.
• Januar 2001: JCB beginnt, seine Online-Inhalte sechs Monate nach Veröffentlichung kostenlos der Öffentlichkeit zugänglich zu machen.
• Juli 2002: JCB führt einen vollständig elektronischen Arbeitsablauf ein.
• September 2002: JCB beginnt mit der Überprüfung aller digitalen Bilder auf Anzeichen von Manipulation.
• Januar 2003: JCB leistet Pionierarbeit mit RGB- Workflow für digitale Farbbilder.
• Juni 2003: JCB stellt sämtliche älteren Inhalte, die älter als sechs Monate sind, ab Band 1, Ausgabe 1, kostenlos der Öffentlichkeit zur Verfügung.
• Mai 2007 – Juli 2010: Emma Hill ist leitende Redakteurin.
• November 2007: JCB beginnt damit, alle seine Inhalte auf PubMed Central zu veröffentlichen , wo sie sechs Monate nach Veröffentlichung kostenlos für die Öffentlichkeit zugänglich sind.
• 1. Mai 2008: Eine neue Urheberrechtsrichtlinie erlaubt es Autoren, das Urheberrecht an ihren eigenen Werken zu behalten, und Dritten, JCB-Inhalte unter einer Creative-Commons-Lizenz wiederzuverwenden .
• Dezember 2008: JCB bringt Dataviewer auf den Markt.
• Januar 2009 – September 2014: Tom Misteli ist Chefredakteur.
• September 2010 – Dezember 2014: Elizabeth H. Williams ist leitende Redakteurin.
• Oktober 2014 – Mai 2015: Alan Hall ist Chefredakteur. ^{[ 18 ]}
• April 2015 – August 2019: Rebecca Alvania ist leitende Redakteurin.
• August 2015 – heute: Jodi Nunnari ist Chefredakteurin. ^{[ 19 ]}
• November 2019 – heute : Tim Spencer ist Chefredakteur

Laut Journal Citation Reports hat die Zeitschrift im Jahr 2024 einen Impact Factor von 6,1 und belegt damit Platz 28 von 201 Zeitschriften in der Kategorie „Zellbiologie“. ^{[ 20 ]}

Die Zeitschrift erschien erstmals online am 13. Januar 1997. Alle Inhalte waren im ersten Jahr der Online-Veröffentlichung kostenlos zugänglich. Im Januar 1998 wurden alle primären Forschungsbeiträge unter Zugangskontrolle gestellt, Nachrichten und Rezensionen blieben jedoch unmittelbar nach Veröffentlichung weiterhin kostenlos.

Im Januar 2001 reagierte die Zeitschrift auf Forderungen aus der Forschungsgemeinschaft nach freiem Zugang zu den Ergebnissen öffentlich finanzierter Forschung und war eine der ersten, die ihre primären Forschungsergebnisse sechs Monate nach Veröffentlichung öffentlich zugänglich machte. ^{[ 21 ]}

Im Juni 2003 wurden sämtliche Inhalte, beginnend mit Band 1, Ausgabe 1, online veröffentlicht und kostenlos zur Verfügung gestellt. ^{[ 22 ]}

Im November 2007, in Erwartung der Vorgabe der National Institutes of Health (NIH), den öffentlichen Zugang zu den Ergebnissen NIH-finanzierter Forschung zu gewährleisten, begann die Zeitschrift, alle ihre Inhalte in PubMed Central zu hinterlegen , wo die endgültige, veröffentlichte Version sechs Monate nach Erscheinen der Öffentlichkeit zugänglich gemacht wird. ^{[ 23 ]}

Im Juli 2000 gehörte die Zeitschrift zu den ersten, die es Autoren ermöglichten, die endgültige, veröffentlichte PDF- Datei ihrer Artikel auf ihren eigenen Websites zu veröffentlichen. ^{[ 24 ]} Am 1. Mai 2008 wurde die Urheberrechtsrichtlinie geändert, sodass Autoren das Urheberrecht an ihren Werken behalten konnten. Gleichzeitig wurde der Inhalt der Zeitschrift unter einer Creative-Commons-Lizenz für die Nutzung durch Dritte freigegeben . Die einzige Einschränkung für diese Nutzung durch Dritte besteht darin, dass sie innerhalb der ersten sechs Monate nach Veröffentlichung keine kostenlose Spiegel-Website erstellen dürfen.

Im Jahr 2002 führte die Zeitschrift einen vollständig elektronischen Produktionsablauf ein. Dies bedeutet, dass alle Texte als elektronische Dokumentdateien und alle Abbildungen als elektronische Bilddateien eingereicht werden. Beim Formatieren der Abbildungsdateien für ein angenommenes Manuskript entdeckte Mike Rossner , der damalige Chefredakteur , einen Western Blot, bei dem die Intensität einer einzelnen Bande im Verhältnis zu den anderen Banden selektiv verändert worden war. Die Originaldaten wurden von den Autoren angefordert, und es war offensichtlich, dass die Manipulation die Interpretation der Daten beeinträchtigte. Die redaktionelle Annahme des Manuskripts wurde widerrufen, und die Zeitschrift führte umgehend eine Richtlinie ein, alle Abbildungen in allen angenommenen Artikeln auf Anzeichen von Bildmanipulation zu überprüfen. ^{[ 25 ]}

In Absprache mit praktizierenden Wissenschaftlern im Redaktionsausschuss wurden Richtlinien für den Umgang mit digitalen Bildern entwickelt, die erstmals im Juni 2003 veröffentlicht wurden. ^{[ 26 ]}

Das Bildprüfungsprogramm der Zeitschrift wurde im April 2005 in einem Artikel in Nature mit dem Titel „CSI Cell Biology“ veröffentlicht. ^{[ 27 ]} Am Weihnachtstag 2005 veröffentlichte die New York Times einen Artikel, der belegte, dass Bildmanipulation Teil des wissenschaftlichen Betrugs von Hwang Woo-Suk und Kollegen war. ^{[ 28 ]} Als deutlich wurde, dass das Prüfprogramm des Journal of Cell Biology die Bildmanipulation vor der Veröffentlichung hätte aufdecken können, hob die New York Times das Verfahren der Zeitschrift am 24. Januar 2006 auf der Titelseite ihrer Wissenschaftsbeilage hervor. ^{[ 29 ]} Dies schärfte das Bewusstsein in der Öffentlichkeit und bei anderen biomedizinischen Fachzeitschriften für den potenziellen Nutzen der Bildprüfung durch Zeitschriftenherausgeber.

Im Februar 2006 forderten die Herausgeber in einem Brief an Ralph Cicerone , den Präsidenten der Nationalen Akademie der Wissenschaften der Vereinigten Staaten, die Entwicklung von gemeinschaftlich anerkannten Standards zur Wahrung der Datenintegrität . ^{[ 30 ]} Dieser Brief sowie nachfolgende Bedenken anderer wissenschaftlicher Verlage hinsichtlich digitaler Daten gaben den Anstoß für eine Studie des Komitees für Wissenschaft, Ingenieurwesen und öffentliche Politik (einer gemeinsamen Einrichtung der Akademie, der Nationalen Akademie der Ingenieurwissenschaften und des Instituts für Medizin ), die sich mit dem Thema Datenintegrität befasste. Die Studie wurde im Mai 2006 in Auftrag gegeben.

Mike Rossner hielt im April 2007 auf einer öffentlichen Sitzung des Komitees einen Vortrag, in dem er die Erfahrungen von JCB und den anderen Zeitschriften des Rockefeller University Press im Umgang mit Bildmanipulationen schilderte. Er merkte an, dass die Entwicklung von Standards für Datenintegrität eigentlich in der Verantwortung der Forschungsgemeinschaft liegen sollte, JCB diese Rolle jedoch übernommen hatte, da es solche Standards nicht gab, als JCB sich 2002 erstmals mit dem Problem auseinandersetzen musste.

Der Ausschuss veröffentlichte im Juli 2009 seinen Bericht mit dem Titel „Gewährleistung der Integrität, Zugänglichkeit und Verwaltung von Forschungsdaten im digitalen Zeitalter“ ^{[ 31 ].} Die NAS-Mitteilung hob insbesondere JCB für dessen proaktive Maßnahmen zur Festlegung konkreter Richtlinien für „zulässige und unzulässige Methoden der Bildmanipulation“ hervor. Der Bericht behandelte das Problem der Datenintegrität sowohl im Hinblick auf die Richtigkeit und Genauigkeit der Datenerfassung und -berichterstattung als auch auf die langfristige Zugänglichkeit der Daten. Er enthielt jedoch keine spezifischen Standards für die Wahrung der Datenintegrität und keine Empfehlungen für deren Durchsetzung nach ihrer Festlegung. Der Bericht kam zu dem Schluss, dass „Forschende selbst für die Integrität ihrer Forschungsdaten verantwortlich sind“.

JCB war die erste Fachzeitschrift, die den RGB-Standard für die Farbwiedergabe einführte. Um die Qualität der Farbwiedergabe zu optimieren, erklärte JCB im Januar 2004 ^{[ 32 ]} , dass die Online-Version der Zeitschrift die maßgebliche Fassung sei und Bilder online in den Originaldateien der Autoren im gleichen Farbschema (Rot, Grün, Blau) wiedergegeben würden, in dem sie von Digitalkameras aufgenommen und auf einem Computermonitor dargestellt werden.

Bisher mussten Autoren ihre RGB- Dateien in das für den Papierdruck notwendige CMYK- Farbschema konvertieren, was zu einem erheblichen Verlust der Bildbrillanz führte. Diese CMYK-Dateien wurden dann vom Verlag für die Online-Veröffentlichung wieder in RGB konvertiert, wodurch die Originalfarben ein zweites Mal verändert wurden. Mit dem neuen RGB-Workflow können die Farben in der Online-Publikation nun exakt so dargestellt werden, wie sie in den Originaldateien der Autoren vorliegen.

Am 1. Dezember 2008 brachte JCB den JCB DataViewer auf den Markt – die erste browserbasierte Anwendung zur Anzeige originaler, mehrdimensionaler Bilddaten. ^{[ 33 ]} Diese Anwendung wurde in Zusammenarbeit mit Glencoe Software ^{[ 34 ]} unter Verwendung einer Datenverwaltungs-Engine entwickelt, die auf der von der Open Microscopy Environment entwickelten OMERO-Software basiert . ^{[ 35 ]} Glencoe Software entwickelte außerdem die Anwendung „Rollup“ zum Hochladen originaler Bilddateien in den DataViewer. Der DataViewer unterstützt zahlreiche proprietäre Dateitypen verschiedener Mikroskope und Geldokumentationssysteme. ^{[ 36 ]}

Diese revolutionäre Anwendung ermöglicht es JCB-Autoren, mehrdimensionale Bilddaten in ihrer ursprünglichen Form darzustellen und so Daten zu teilen, die zuvor nicht zugänglich waren. JCB-Leser erhalten Einblick in die Originaldaten einer veröffentlichten Arbeit und können diese interaktiv erkunden, indem sie durch Bildstapel oder Zeitrafferaufnahmen scrollen. Nutzer können einzelne Kanäle auswählen oder alle Kanäle separat auf demselben Bildschirm anzeigen lassen. Zudem können sie Liniendiagramme der Pixelintensitäten entlang beliebiger horizontaler oder vertikaler Achsen erstellen.

Ein Software-Update vom August 2012 ermöglicht dem Benutzer einen nahtlosen Übergang von 1-Millimeter- zu 1-Mikrometer-Vergrößerung von Bildern, die aus optischen und Elektronenmikroskopen zusammengesetzt wurden. Beispielsweise liefern sie ein vollständiges Bild eines Zebrafischembryos. ^{[ 37 ] [ 38 ]}

• Offizielle Website