Takifugu rubripes

Takifugu rubripes , allgemein bekannt als Japanischer Kugelfisch , Tigerkugelfisch oder Torafugu ( japanisch :虎河豚), ist ein Kugelfisch der Gattung Takifugu . Er zeichnet sich durch sein sehr kleines, vollständig sequenziertes Genom aus ,da er als Modellorganismus dient und in der Genomik weit verbreitet als Referenz verwendet wird. ^{[ 4 ]}

Die Art wird in der Genomikliteratur häufig als Fugu rubripes bezeichnet . Die Gattung Fugu ist ein Synonym für die aktuell bevorzugte Gattung Takifugu . ^{[ 5 ]} Takifugu ist Japanisch für Kugelfisch, und rubripes stammt vom lateinischen ruber und pēs, was so viel wie „roter Fuß“ bedeutet.

Die Art ist im Japanischen Meer , Ostchinesischen Meer und Gelben Meer bis ins südliche Sachalin in Tiefen von 10–135 m verbreitet. Sie ist eine bodenlebende Art. Das Laichen erfolgt in Flussmündungen ; Jungfische tolerieren ein breites Spektrum an Salzgehalten und verbleiben ein Jahr lang in Flussmündungen und Lagunen, wo sie heranwachsen, bevor sie endgültig ins offene Meer abwandern. ^{[ 1 ]}

Eine Besonderheit dieser Spezies ist ihr sehr kleines Genom , das als Referenzgenom zur Identifizierung von Genen und anderen Elementen im menschlichen und anderen Wirbeltiergenomen dient. Das Genom wurde 2002 vom Internationalen Kugelfisch-Genomkonsortium mittels Shotgun-Sequenzierung des gesamten Genoms veröffentlicht. Nach dem Beginn der Forschung im Jahr 1989 war es das erste Wirbeltiergenom nach dem menschlichen, das öffentlich zugänglich gemacht wurde. ^{[ 6 ]} Es zählt weiterhin zu den kleinsten bekannten Wirbeltiergenomen; seine Basenpaarzahl beträgt etwa 6 % und die Anzahl der bisher bekannten proteinkodierenden Gene etwa 13 % derjenigen des menschlichen Genoms, obwohl die Anzahl der Chromosomen (22) mit der des Menschen (23) vergleichbar ist. Dies macht es besonders wertvoll für vergleichende Studien. Aktuelle Schätzungen gehen von insgesamt 392.376.244 Basenpaaren , 1.138 bekannten und 18.093 neuartigen proteinkodierenden Genen sowie 593 RNA-Genen aus . ^{[ 7 ]}

Eine Torafugu-Art, der 22-Seiki-Fugu (wörtlich „Fugu des 22. Jahrhunderts“), wurde gentechnisch verändert, indem vier Leptinrezeptorgene , die den Appetit regulieren, entfernt wurden. Dies führte zu gesteigertem Appetit und Gewichtszunahme; die Fische wachsen durchschnittlich 1,9-mal schneller als normale Torafugu. Sie werden als Lebensmittel kommerziell verkauft. ^{[ 8 ] [ 9 ]}

Wie bei einigen anderen Kugelfischen enthalten auch beim Japanischen Kugelfisch bestimmte Organe Tetrodotoxin und sind hochgiftig. Das Toxin ist in Leber und Eierstöcken stark konzentriert, in geringen Mengen im Darm und im Fleisch vorhanden und fehlt in Haut und Hoden. ^{[ 1 ]}

Der Japanische Kugelfisch wird von der IUCN als potenziell gefährdet eingestuft . Er zählt zu den wertvollsten Speisefischen Japans, und obwohl die aktuellen Fangmengen (101 Tonnen pro Jahr im Jahr 2004, gegenüber einem Höchststand von 2.000 Tonnen im Jahr 1987) im Vergleich zu vielen anderen Speisefischarten wie Sardinen und Sardellen gering sind , scheinen sie nicht nachhaltig zu sein und verhindern die Erholung des Bestandes nach der früheren Überfischung. Zur Unterstützung der Erholung wurden Fanggerätebeschränkungen (die meisten Fänge erfolgen mit Langleinen ) und Anpassungen der Fangzeiten zum Schutz der Jungfische empfohlen. Die Art wird in großem Umfang in Aquakulturen gezüchtet . ^{[ 1 ]}

• Fugu-Genomprojekt
• Interaktive Chromosomen-Kopplungskarte
• Das Fugu-Genom kann auf Ensembl eingesehen werden.