Protein domains

Ein ATP-Bindungsmotiv ist eine 250 Aminosäuren umfassende Sequenz innerhalb der Primärstruktur eines ATP - bindenden Proteins. Das Bindungsmotiv ist mit der Struktur und/oder Funktion des Proteins assoziiert.

Bakterielle Eisnukleationsproteine ​​sind eine Proteinfamilie , die es gramnegativen Bakterien ermöglicht, die Eisbildung bei relativ hohen Temperaturen (über −5 °C) zu fördern .

In der Molekularbiologie ist die Beta-Ketoacyl-ACP-Synthase EC 2.3.1.41 ein Enzym , das an der Fettsäuresynthese beteiligt ist .

In Proteinstrukturen ist ein Beta-Fass (β-Fass) ein Beta-Faltblatt (β-Faltblatt), das aus Tandemwiederholungen besteht und sich zu einer geschlossenen, ringförmigen Struktur windet, in der der erste Strang über eine

Botulinumtoxin , auch Botulinumneurotoxin oder Botox genannt, ist ein neurotoxisches Protein , das vom Bakterium Clostridium botulinum und verwandten Arten produziert wird und als die tödlichste bekannte natürliche

Die basische Leucin-Zipper-Domäne ( bZIP-Domäne ) kommt in vielen DNA- bindenden eukaryotischen Proteinen vor.

Ein C-Typ-Lektin ( CLEC ) ist ein Kohlenhydrat-bindendes Protein , das als Lektin bekannt ist . Die Bezeichnung C-Typ leitet sich von der Notwendigkeit von Calcium für die Bindung ab.

Die Carbamoylphosphatsynthetase katalysiert die ATP-abhängige Synthese von Carbamoylphosphat aus Glutamin ( EC 6.3.5.5 ) oder Ammoniak ( EC 6.3.4.16 ) und Bicarbonat.

1CDH , 1CDI , 1CDJ , 1CDU , 1CDY , 1G9M , 1G9N , 1GC1 , 1JL4 , 1Q68 , 1RZJ , 1RZK , 1WIO , 1WIP , 1WIQ , 2B4C , 2JKR , 2JKT , 2KLU , 2NXY , 2NXZ , 2NY0 , 2NY1 , 2NY2 , 2NY3 , 2NY4 , 2NY5 , 2NY6 , 2QAD , 3B71 , 3CD4 ,

Der Kohlenstoffspeicherregulator A ( CsrA ) ist ein RNA-bindendes Protein , das erstmals in Escherichia coli identifiziert wurde . Homologe von CsrA finden sich in vielen Bakterienarten und Pathogenen .

Cytochrom b ist ein Protein, das in den Membranen aerober Zellen vorkommt. In eukaryotischen Mitochondrien (innere Membran) und in aeroben Prokaryoten ist Cytochrom b Bestandteil des Atmungskettenkomplexes III ( EC

Cytochrome c (Cyt c , Cytochrome vom c-Typ) sind Cytochrome oder Häm -haltige Proteine , bei denen Häm C über eine oder zwei Thioetherbindungen kovalent an das Peptidgerüst gebunden ist .

Das Diphtherietoxin ist ein Exotoxin, das hauptsächlich von Corynebacterium diphtheriae (aber auch von Corynebacterium ulcerans und Corynebacterium pseudotuberculosis ), dem Erreger der Diphtherie, sezerniert wird .

Eine DNA-Bindungsdomäne ( DBD ) ist eine unabhängig gefaltete Proteindomäne , die mindestens ein Strukturmotiv enthält , das doppel- oder einzelsträngige DNA erkennt .

ENA/VASP-Homologieproteine ​​oder EVH -Proteine ​​bilden eine Familie eng verwandter Proteine, die an der Zellmotilität von Wirbeltieren und Wirbellosen beteiligt sind .

F-Box-Proteine , manchmal auch als FBX abgekürzt , sind Proteine, die mindestens eine F-Box-Domäne enthalten.

Fructose-Bisphosphat-Aldolase ( EC 4.1.2.13 ), oft einfach Aldolase genannt , ist ein Enzym , das eine reversible Reaktion katalysiert , welche das Aldol Fructose-1,6-bisphosphat in die Triosephosphate

Die Vitamin-K-abhängige Carboxylierungs-/γ-Carboxyglutaminsäure- Domäne ( GLA- Domäne ) ist eine Proteindomäne , die posttranslationale Modifikationen zahlreicher Glutamatreste durch Vitamin-K -abhängige Carboxylierung

In molecular biology, the glucose-methanol-choline oxidoreductase family (GMC oxidoreductase) is a family of enzymes with oxidoreductase activity.

Glycerin-3-phosphat-Dehydrogenase ( GPDH ) ist ein Enzym , das die reversible Redox-Umwandlung von Dihydroxyacetonphosphat (auch bekannt als Glycerinphosphat, veraltet) in sn- Glycerin-3-phosphat katalysiert .

Hemerythrin (auch Haemerythrin ; Altgriechisch : αἷμα , romanisiert : haîma , wörtlich „ Blut “ , Altgriechisch : ἐρυθρός , romanisiert : erythrós , wörtlich „ rot “ ) ist ein oligomeres Protein , das für den

Das Insulin-ähnliche Wachstumsfaktor-Bindungsprotein ( IGFBP ) dient als Transportprotein für den Insulin-ähnlichen Wachstumsfaktor 1 (IGF-1).

1BBN , 1BCN , 1CYL , 1HIJ , 1HIK , 1HZI , 1IAR , 1ITI , 1ITL , 1ITM , 1RCB , 2B8U , 2B8X , 2B8Y , 2B8Z , 2B90 , 2B91 , 2CYK , 2D48 , 2INT , 3BPL , 3BPN , 3QB7 , 4YDY , 5FHX

Der Interleukin-4-Rezeptor ist ein Zytokinrezeptor vom Typ I. Er ist ein Heterodimer , d. h. er besteht aus zwei Untereinheiten.

1kun :3110-3162 1bik :286-338 1shp :2-54 1jc6 A:6-58 1bf0 :6-58 1dtk :26-78 1dtx :6-58 1den :6-58 1dem :6-58 1zr0 D:35-87 1irh A:216-268 1adz :124-176 1tfx C:124-176 1d0d B:39-91 1k6u A:39-91 2fi4 I:39-91 1aal A:39-91

In der Molekularbiologie stellt die Familie der Lipid-bindenden Serumglykoproteine , auch bekannt als BPI/LBP/Plunc-Familie oder LBP/BPI/CETP-Familie, eine Gruppe von Säugetier-Lipid-bindenden Serumglykoproteinen und /

In der Molekularbiologie ist Luciferase ein Oberbegriff für die Klasse der oxidativen Enzyme , die Biolumineszenz erzeugen , und wird üblicherweise von Photoproteinen unterschieden .

In der Molekularbiologie ist die LysM-Domäne eine Proteindomäne, die in einer Vielzahl extrazellulärer Proteine ​​und Rezeptoren vorkommt.

Lysosomenassoziierte Membranglykoproteine ​​( LAMPs ) sind integrale Membranproteine , die spezifisch für Lysosomen sind und deren genaue biologische Funktion noch nicht vollständig geklärt ist.

Die metabotropen Glutamatrezeptoren ( mGluRs ) sind eine Art von Glutamatrezeptoren , die über einen indirekten metabotropen Prozess aktiv sind . Sie gehören zur Gruppe C der G-Protein-gekoppelten Rezeptoren (GPCRs).

Die Metallo-β-Lactamase (MBL)-Superfamilie umfasst eine Gruppe von Proteinen, die in allen Domänen des Lebens vorkommen und eine charakteristische αββα-Faltung sowie die Fähigkeit zur Bindung von Übergangsmetallionen

Monooxygenasen sind Enzyme, die in vielen Stoffwechselwegen eine Hydroxylgruppe (−OH) in Substrate einbauen .

Moricin ist ein stark basisches antibakterielles Peptid , das aus dem Seidenspinner Bombyx mori isoliert wurde .

Motilin ist ein aus 22 Aminosäuren bestehendes Polypeptidhormon aus der Motilinfamilie, das beim Menschen durch das MLN -Gen kodiert wird .

Die bakterielle Zellwand verleiht Festigkeit und Stabilität , um dem inneren osmotischen Druck entgegenzuwirken und Schutz vor der Umgebung zu bieten.

Der Myosinkopf ist der Teil des dicken Myofilaments , der bei der Muskelkontraktion durch Gleiten über dünne Aktinfilamente wirkt.

Nuclease S1 ( EC 3.1.30.1 ) ist ein Endonuklease- Enzym , das einzelsträngige DNA (ssDNA) und RNA in Oligo- oder Mononukleotide spaltet . Dieses Enzym katalysiert die folgende chemische Reaktion.

In der Molekularbiologie ist die OB-Faltung (Oligonukleotid-/Oligosaccharid-Bindungsfaltung) ein kleines Proteinstrukturmotiv, das in verschiedenen Proteinen vorkommt, die Oligonukleotide oder Oligosaccharide binden .

PANDIT ist eine Datenbank mit multiplen Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen, die viele häufige Proteindomänen abdecken .

Prenyltransferasen (PTs) sind eine Enzymklasse , die allylische Prenylgruppen auf Akzeptormoleküle überträgt. Der Begriff Prenyltransferasen wird häufig auch als Isoprenyldiphosphat-Synthese (IPPS) bezeichnet.

In der Molekularbiologie bezeichnet man als Proteindomäne einen selbststabilisierenden Bereich der Polypeptidkette eines Proteins , der sich unabhängig vom Rest faltet .

Die Rel-Homologiedomäne (RHD) ist eine Proteindomäne, die in einer Familie eukaryotischer Transkriptionsfaktoren vorkommt , zu denen unter anderem NF-κB und NFAT gehören .

Die Eukaryotic Linear Motif (ELM)-Ressource ist eine computerbiologische Ressource (entwickelt am Europäischen Laboratorium für Molekularbiologie (EMBL)) zur Untersuchung kurzer linearer Motive (SLiMs) in eukaryotischen

Rhodopsin-ähnliche Rezeptoren sind eine Proteinfamilie , die die größte Gruppe der G-Protein-gekoppelten Rezeptoren darstellt .

Ribonuklease III (RNase III oder RNase C) (BRENDA 3.1.26.3 ) ist eine Ribonuklease , die doppelsträngige RNA (dsRNA) erkennt und diese an spezifischen Stellen spaltet, um sie in reife RNA umzuwandeln.

Der Ribonuklease-Inhibitor (RI) ist ein großes (~450 Aminosäuren, ~49 kDa), saures (pI ~4,7), leucinreiches Repeat- Protein , das extrem stabile Komplexe mit bestimmten Ribonukleasen bildet .

Die Selektine ( Cluster of Differentiation 62 oder CD62 ) sind eine Familie von Zelladhäsionsmolekülen ( CAMs ).

Die SH2- Domäne ( Src - Homologie 2 ) ist eine strukturell konservierte Proteindomäne, die im Src- Onkoprotein und in vielen anderen intrazellulären Signaltransduktionsproteinen vorkommt .

In der Molekularbiologie gehört diese Proteindomäne zur Familie der Terpensynthasen ( TPS). Ihre Aufgabe ist die Synthese von Terpenen , die Bestandteil des Primärstoffwechsels ( z. B.

In der Molekularbiologie gehört diese Proteindomäne zur Familie der Terpensynthasen ( TPS). Ihre Aufgabe ist die Synthese von Terpenen , die Bestandteil des Primärstoffwechsels (z. B.

Thrombospondine ( TSPs ) sind eine Familie sekretierter Glykoproteine ​​mit antiangiogenen Funktionen. Aufgrund ihrer dynamischen Rolle in der extrazellulären Matrix werden sie als Matrixproteine ​​betrachtet .

TopFIND ( TopFIND ) ist eine integrierte Wissensdatenbank, die sich auf Proteintermini , deren Bildung durch Proteasen und deren funktionelle Implikationen konzentriert .

Die Superfamilie der transformierenden Wachstumsfaktoren beta ( TGF-β ) ist eine große Gruppe strukturell verwandter zellulärer regulatorischer Proteine , die nach ihrem ersten Mitglied, TGF-β1 , benannt wurde , das

Das Tubby-Protein wird vom TUB -Gen kodiert . Es ist ein vorgelagertes Zellsignalprotein , das in vielzelligen Eukaryoten vorkommt .

Das WH2-Motiv bzw. die WH2-Domäne ist ein evolutionär konserviertes Sequenzmotiv, das in Proteinen vorkommt .